发明名称 双链接头、其应用及构建末端配对DNA文库的方法
摘要 本发明公开了一种提双链接头、其应用及构建末端配对DNA文库的方法。双链接头包括接头A和接头B,接头A和接头B分别包括一个LoxP序列和将LoxP序列同方向地连接到待环化的DNA片段两端的辅助序列。应用本发明的技术方案,基于Cre重组酶/LoxP作用系统特性(当两个LoxP序列位于一条DNA链上,且方向相同,Cre重组酶能有效切除两个LoxP位点间的序列,而切除部分的序列将自动成环形状态而实现DNA长片段的环化)设计的双连接头,通过T-A克隆的方式高效地连接到用于构建末端配对DNA文库的DNA片段的两端,然后采用Cre重组酶体系能够高效的使用于构建末端配对DNA文库的DNA片段环化。
申请公布号 CN103667273B 申请公布日期 2016.01.20
申请号 CN201310655625.7 申请日期 2013.12.05
申请人 北京诺禾致源生物信息科技有限公司 发明人 蒋智;王大伟;刘运超;曹志生;刘建;魏勤;杜长诗
分类号 C12N15/11(2006.01)I;C40B40/06(2006.01)I;C40B50/06(2006.01)I;C12N15/10(2006.01)I;C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12N15/11(2006.01)I
代理机构 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 代理人 吴贵明;张永明
主权项 一种双链接头,其特征在于,包括接头A和接头B,所述接头A和所述接头B分别包括一个LoxP序列和将所述LoxP序列同方向地连接到待环化的DNA片段两端的辅助序列;所述接头A中的所述LoxP序列为正向LoxP序列,所述接头A中的所述辅助序列包括位于所述正向LoxP序列上游的粘性末端,以及位于所述正向LoxP序列下游的具有突出的3’T末端,所述接头A两条链的5’末端第一个碱基分别进行了磷酸化修饰,且所述正向LoxP序列的第32位碱基T进行了生物素标记;所述接头B中的所述LoxP序列为反向LoxP序列,所述接头B中的所述辅助序列包括位于所述反向LoxP序列上游的粘性末端,以及位于所述反向LoxP序列下游的具有突出的3’T末端,所述接头B两条链的5’末端第一个碱基分别进行了磷酸化修饰,且所述反向LoxP序列的第32位碱基T进行了生物素标记;所述接头A的碱基序列如图1所示,所述接头B的碱基序列如图2所示。
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