支架化肽文库以及其制备和筛选方法

摘要

提供了支架化肽文库以及针对与靶蛋白的特异性结合筛选所述支架化肽文库的方法。每个文库包含不同的肽化合物，所述肽化合物包含支架结构域和不同的可变结构域。提供了多种文库，其中每种文库基于作为基础的具有结构基序的肽支架。在一些实施方案中，所述肽支架是具有蛋白质-蛋白质相互作用表面的小蛋白。提供了编码多种肽化合物的多核苷酸的文库。这些文库用于需要与靶分子(例如靶蛋白)特异性结合的多种应用。还提供了制备所述文库的方法以及针对与靶标的结合筛选所述文库的方法。

主权项

不同肽化合物的文库，其中所述文库的每个化合物包含不同的可变结构域以及肽支架结构域，其中所述肽支架结构域选自：DiGeorge综合征关键区域8(DGCR8)二聚体化结构域；Get5 C‑末端结构域；来自E.coli的H‑NS结构域；KorB c‑末端二聚体化结构域；Lsr2二聚体化结构域；PKA‑RIα二聚体化/停靠结构域(牛)；p62的UBA结构域；SpoVT的N‑末端结构域；胶原XI三聚体化结构域；Symfoil 4P三聚体(被称为β‑三叶肽)；RNA聚合酶α亚基的C‑末端结构域；EphA2 SAM结构域；高尔基体蛋白245的GRIP结构域；SpoOB‑螺旋发夹结构域；Ku的C‑末端结构域；Cue2蛋白的CUE结构域；DNA解旋酶RuvA结构域；蛋白G的GA结构域；Hirustasin；凝血调节蛋白(EGF型结构域)；凝集因子VIIa；PEM‑1样蛋白；成束蛋白‑2；CD46细胞外结构域；核苷酸交换因子C‑末端结构域；TDRD3的Tudor结构域；转录抗终止蛋白NusG；CCL2趋化因子；与ThiF复合的ThiS蛋白；胰凝乳蛋白酶抑制子；羧肽酶抑制子；CD2bp2的GYF结构域；Cdk调节亚基1；CN2毒素；CHD4–PHD指结构域；GATA型锌指；Leech衍生类胰蛋白酶抑制子；Rhodnin Kazal抑制子；MHC II型p41片段；抗TRAP；TNF受体17(BCMA)；NZF锌指结构域；Amaranthα淀粉酶抑制子；Sac7d(Nanofitins)；APPI Kunitz结构域；Fyn SH3结构域(Fynomers)；E3泛素蛋白连接酶UBR5；DNA修复核酸内切酶XPF；链B:rad23 hom.B,xpcb结构域；链B:dsk2‑uba结构域；链C:LEM结构域/伊默菌素；链A:蛋白YBL047CUBA结构域；链A/B:PKA停靠/二聚体化结构域；链C:GspC；链A:噬菌体IF1附接蛋白G3P；链A:cd2ap sh3；链B:微线蛋白6,EGF‑样结构域；链B:大肠杆菌素‑A；链B:玉红氧还蛋白2；链E:LDLR的EGF结构域；链I:工程化蛋白酶抑制子,SGPI支架；链B:工程化hck sh3；N‑末端片段:NTL9；植物甜蛋白；胰岛素生长因子结合蛋白(IGFBP)；火鸡卵类粘蛋白,第三结构域(OMTKY3)；粘霉素A1；染色盒蛋白同系物5；绒毛蛋白头部亚结构域；和蛋白Z结构域。