发明名称 一种获取鸡全基因组高密度SNP标记位点的方法
摘要 本发明属于基因工程技术领域,提供了一种获取鸡全基因组高密度SNP标记位点的方法,包括以下步骤:(1)预测用EcoRI与MseI的双酶切鸡基因组所获得的酶切片段分布情况;(2)根据EcoRI与MseI的酶切片段分布特点设计通用接头、条形码接头及PCR扩增引物;(3)构建简化基因组测序文库;(4)利用步骤(3)构建的文库进行上机测序;(5)根据测序结果获得SNP标记位点。为不同品种的鸡利用双酶切GBS构建全基因组高密度SNP图谱提供了一种通用的策略,使得获取每个SNP标记位点的成本比传统芯片技术降低一个数量级,该方法技术稳定,重复性高。
申请公布号 CN105238859A 申请公布日期 2016.01.13
申请号 CN201510657602.9 申请日期 2015.10.13
申请人 中国农业大学 发明人 胡晓湘;王宇哲;曹学敏;李宁
分类号 C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 代理人 王文君
主权项 一种获取鸡全基因组高密度SNP标记位点的方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)预测用EcoRI与MseI的双酶切鸡基因组所获得的酶切片段分布情况;(2)根据EcoRI与MseI的酶切片段分布特点设计通用接头、条形码接头及PCR扩增引物;(3)构建简化基因组测序文库;(4)利用步骤(3)构建的文库进行上机测序;(5)根据测序结果获得SNP标记位点。
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