通过适应性免疫受体多样性和克隆性表征进行的免疫能力评估

摘要

公开了用于确定受试者的适应性免疫系统的免疫状态的方法，其是通过鉴别和定量来自所述受试者的淋巴含DNA样品中编码T细胞受体(TCR)和/或免疫球蛋白(IG)多肽的重排DNA(和/或随后转录的RNA)序列。TCR和/或IG序列多样性和序列分布允许免疫能力和免疫库评估并反映所述样品中T细胞或B细胞克隆性和克隆扩增的程度。还描述了基于免疫能力，包括对免疫疗法反应的可能性，将患者群体分级的方法。

主权项

一种用于确定测试受试者的免疫状态的方法，其包括：获得从一个或多个包含来自所述测试受试者的淋巴样细胞的核酸的样品产生的核酸序列信息，其中所述核酸序列信息包含多个独特重排核酸序列的序列，所述多个独特重排核酸序列的每一个均编码AIR多肽，所述一个或多个样品是在一个或多个时间点从所述测试受试者获得；对于所述一个或多个样品，使用所述核酸序列信息，确定所述样品中所观测到的重排序列的总数目；确定所述样品中独特重排DNA序列的总数目；基于所述独特重排DNA序列的总数目，定量所述一个或多个样品的AIR序列多样性分数；通过将每个独特重排DNA序列的出现频率计算为所述一个或多个样品中所述所观测到的重排序列的总数目的百分比来定量所述一个或多个样品的AIR序列分布分数；以及基于所述测试受试者的所述AIR序列多样性分数和所述AIR序列分布分数确定测试受试者评级分数以确定所述测试受试者的所述免疫状态。