非天然型塩基を含むオリゴデオキシヌクレオチドの切断による５’末端リン酸化オリゴデオキシヌクレオチドの製造方法

摘要

非天然型塩基を含むデオキシヌクレオチドをDNA鎖に導入することにより、化学反応によって低コスト且つ簡単な実験操作でDNA鎖の切断を行い、結果として生じた末端がリン酸化されたオリゴデオキシヌクレオチドを提供する。本発明は、求核剤と式Iで表されるオリゴデオキシヌクレオチドとを接触させることによって、式Iで表されるオリゴデオキシヌクレオチドに含まれる非天然型塩基を含むデオキシヌクレオシドBの3’位とCの5’末端との間のホスホジエステル結合が、Cの5’末端がリン酸化されたオリゴデオキシヌクレオチド部分がBの3’位から脱離することによって切断されて、5’末端がリン酸化されたオリゴデオキシヌクレオチドCを得る、5’末端リン酸化オリゴデオキシヌクレオチド形成工程を含む、オリゴデオキシヌクレオチドの製造方法に関する。