光可断裂的标记核苷酸和核苷与标记的核苷酸和核苷以及其在DNA测序中的使用方法

摘要

本发明提供了可用在DNA测序技术和其它类型的DNA分析中的本文所述的新的核苷酸、核苷及其衍生物。在一个实施方案中，具有未保护的3’-OH的核苷酸或核苷在核碱基上被衍生成包括通过连接物与不可断裂的终止基团连接的荧光染料。所述不可断裂的荧光基团被设计成终止DNA合成，使得可以平行模式对DNA寡聚体进行有效测序。在另一个实施方案中，具有未保护的3’-OH的核苷酸或核苷在核碱基上被衍生成包括通过连接物与光可断裂的终止基团连接的荧光染料。所述光可断裂的荧光基团被设计成终止DNA合成以及被断裂，使得可以平行模式对DNA寡聚体进行有效测序。

主权项

1.下式的化合物：其中R1是H、单磷酸酯、二磷酸酯或三磷酸酯，R2是H或OH，所述碱基是胞嘧啶、尿嘧啶、胸腺嘧啶、腺嘌呤或鸟嘌呤或其天然衍生物，所述可断裂的终止部分是赋予所述化合物以聚合酶终止性能的基团，所述连接物是双官能团，以及所述染料是荧光团。