发明名称 用于检测与糖尿病相关的SNP位点组合的成套引物及其应用
摘要 本发明公开了一种用于检测与糖尿病相关的SNP位点组合的成套引物及其应用。本发明用于检测与糖尿病相关的SNP位点组合的成套引物由引物1)-引物47组成。通过试验证明:用本发明的成套引物可以准确的检测出与糖尿病相关的SNP位点组合的分型结果,并且可以综合评定个体发病风险,比单位点分析结果更为准确,另外本发明所摘录的SNP位点均为东亚人群中验证的2型糖尿病及并发症相关位点,对人群2型糖尿病的预测、预防和个体化诊疗效果更好。
申请公布号 CN105112502A 申请公布日期 2015.12.02
申请号 CN201510393858.3 申请日期 2015.07.07
申请人 博奥颐和健康科学技术(北京)有限公司;博奥生物集团有限公司;清华大学;上海市第六人民医院 发明人 谢兰;贾伟平;孙义民;胡承;邵林;程京
分类号 C12Q1/68(2006.01)I;C12N15/11(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人 关畅;白艳
主权项 一种用于检测如下SNP位点:rs10229583、rs10811661、rs10886471、rs1111875、rs12742393、rs12779790、rs13266634、rs1535500、rs16856187、rs16861329、rs1801282、rs2237892、rs340874、rs3786897、rs4430796、rs5219、rs6017317、rs6467136、rs6815464、rs7041847、rs7172432、rs7612463、rs7651090、rs7756992、rs780094、rs7903146、rs8050136、rs831571、rs9470794、rs2268388、rs9565164、rs4668142、rs2380261、rs39059、rs17756941、rs245955、rs245962、rs266729、rs3811951、rs156019、rs6234、rs3856806、rs10494366、rs11977021、rs2230806、rs11212617和rs622342的成套引物,其由引物1)‑引物47)组成;所述引物1)包括用于检测rs10229583的扩增引物1);所述引物2)包括用于检测rs10811661的扩增引物2);所述引物3)包括用于检测rs10886471的扩增引物3);所述引物4)包括用于检测rs1111875的扩增引物4);所述引物5)包括用于检测rs12742393的扩增引物5);所述引物6)包括用于检测rs12779790的扩增引物6);所述引物7)包括用于检测rs13266634的扩增引物7);所述引物8)包括用于检测rs1535500的扩增引物8);所述引物9)包括用于检测rs16856187的扩增引物9);所述引物10)包括用于检测rs16861329的扩增引物10);所述引物11)包括用于检测rs1801282的扩增引物11);所述引物12)包括用于检测rs2237892的扩增引物12);所述引物13)包括用于检测rs340874的扩增引物13);所述引物14)包括用于检测rs3786897的扩增引物14);所述引物15)包括用于检测rs4430796的扩增引物15);所述引物16)包括用于检测rs5219的扩增引物16);所述引物17)包括用于检测rs6017317的扩增引物17);所述引物18)包括用于检测rs6467136的扩增引物18);所述引物19)包括用于检测rs6815464的扩增引物19);所述引物20)包括用于检测rs7041847的扩增引物20);所述引物21)包括用于检测rs7172432的扩增引物21);所述引物22)包括用于检测rs7612463的扩增引物22);所述引物23)包括用于检测rs7651090的扩增引物23);所述引物24)包括用于检测rs7756992的扩增引物24);所述引物25)包括用于检测rs780094的扩增引物25);所述引物26)包括用于检测rs7903146的扩增引物26);所述引物27)包括用于检测rs8050136的扩增引物27);所述引物28)包括用于检测rs831571的扩增引物28);所述引物29)包括用于检测rs9470794的扩增引物29);所述引物30)包括用于检测rs2268388的扩增引物30);所述引物31)包括用于检测rs9565164的扩增引物31);所述引物32)包括用于检测rs4668142的扩增引物32);所述引物33)包括用于检测rs2380261的扩增引物33);所述引物34)包括用于检测rs39059的扩增引物34);所述引物35)包括用于检测rs17756941的扩增引物35);所述引物36)包括用于检测rs245955的扩增引物36);所述引物37)包括用于检测rs245962的扩增引物37);所述引物38)包括用于检测rs266729的扩增引物38);所述引物39)包括用于检测rs3811951的扩增引物39);所述引物40)包括用于检测rs156019的扩增引物40);所述引物41)包括用于检测rs6234的扩增引物41);所述引物42)包括用于检测rs3856806的扩增引物42);所述引物43)包括用于检测rs10494366的扩增引物43);所述引物44)包括用于检测rs11977021的扩增引物44);所述引物45)包括用于检测rs2230806的扩增引物45);所述引物46)包括用于检测rs11212617的扩增引物46);所述引物47)包括用于检测rs622342的扩增引物47);所述用于检测rs10229583的扩增引物1)由序列表中序列1所示的单链DNA分子和序列表中序列2所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs10811661的扩增引物2)由序列表中序列3所示的单链DNA分子和序列表中序列4所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs10886471的扩增引物3)由序列表中序列5所示的单链DNA分子和序列表中序列6所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs1111875的扩增引物4)由序列表中序列7所示的单链DNA分子和序列表中序列8所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs12742393的扩增引物5)由序列表中序列9所示的单链DNA分子和序列表中序列10所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs12779790的扩增引物6)由序列表中序列11所示的单链DNA分子和序列表中序列12所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs13266634的扩增引物7)由序列表中序列13所示的单链DNA分子和序列表中序列14所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs1535500的扩增引物8)由序列表中序列15所示的单链DNA分子和序列表中序列16所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs16856187的扩增引物9)由序列表中序列17所示的单链DNA分子和序列表中序列18所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs16861329的扩增引物10)由序列表中序列19所示的单链DNA分子和序列表中序列20所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs1801282的扩增引物11)由序列表中序列21所示的单链DNA分子和序列表中序列22所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs2237892的扩增引物12)由序列表中序列23所示的单链DNA分子和序列表中序列24所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs340874的扩增引物13)由序列表中序列25所示的单链DNA分子和序列表中序列26所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs3786897的扩增引物14)由序列表中序列27所示的单链DNA分子和序列表中序列28所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs4430796的扩增引物15)由序列表中序列29所示的单链DNA分子和序列表中序列30所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs5219的扩增引物16)由序列表中序列31所示的单链DNA分子和序列表中序列32所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs6017317的扩增引物17)由序列表中序列33所示的单链DNA分子和序列表中序列34所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs6467136的扩增引物18)由序列表中序列35所示的单链DNA分子和序列表中序列36所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs6815464的扩增引物19)由序列表中序列37所示的单链DNA分子和序列表中序列38所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs7041847的扩增引物20)由序列表中序列39所示的单链DNA分子和序列表中序列40所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs7172432的扩增引物21)由序列表中序列41所示的单链DNA分子和序列表中序列42所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs7612463的扩增引物22)由序列表中序列43所示的单链DNA分子和序列表中序列44所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs7651090的扩增引物23)由序列表中序列45所示的单链DNA分子和序列表中序列46所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs7756992的扩增引物24)由序列表中序列47所示的单链DNA分子和序列表中序列48所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs780094的扩增引物25)由序列表中序列49所示的单链DNA分子和序列表中序列50所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs7903146的扩增引物26)由序列表中序列51所示的单链DNA分子和序列表中序列52所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs8050136的扩增引物27)由序列表中序列53所示的单链DNA分子和序列表中序列54所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs831571的扩增引物28)由序列表中序列55所示的单链DNA分子和序列表中序列56所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs9470794的扩增引物29)由序列表中序列57所示的单链DNA分子和序列表中序列58所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs2268388的扩增引物30)由序列表中序列59所示的单链DNA分子和序列表中序列60所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs9565164的扩增引物31)由序列表中序列61所示的单链DNA分子和序列表中序列62所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs4668142的扩增引物32)由序列表中序列63所示的单链DNA分子和序列表中序列64所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs2380261的扩增引物33)由序列表中序列65所示的单链DNA分子和序列表中序列66所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs39059的扩增引物34)由序列表中序列67所示的单链DNA分子和序列表中序列68所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs17756941的扩增引物35)由序列表中序列69所示的单链DNA分子和序列表中序列70所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs245955的扩增引物36)由序列表中序列71所示的单链DNA分子和序列表中序列72所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs245962的扩增引物37)由序列表中序列73所示的单链DNA分子和序列表中序列74所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs266729的扩增引物38)由序列表中序列75所示的单链DNA分子和序列表中序列76所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs3811951的扩增引物39)由序列表中序列77所示的单链DNA分子和序列表中序列78所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs156019的扩增引物40)由序列表中序列79所示的单链DNA分子和序列表中序列80所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs6234的扩增引物41)由序列表中序列81所示的单链DNA分子和序列表中序列82所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs3856806的扩增引物42)由序列表中序列83所示的单链DNA分子和序列表中序列84所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs10494366的扩增引物43)由序列表中序列85所示的单链DNA分子和序列表中序列86所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs11977021的扩增引物44)由序列表中序列87所示的单链DNA分子和序列表中序列88所示的单链DNA分子组成。所述用于检测rs2230806的扩增引物45)由序列表中序列89所示的单链DNA分子和序列表中序列90所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs11212617的扩增引物46)由序列表中序列91所示的单链DNA分子和序列表中序列92所示的单链DNA分子组成;所述用于检测rs622342的扩增引物47)由序列表中序列93所示的单链DNA分子和序列表中序列94所示的单链DNA分子组成。
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