发明名称 基于宏基因组学的病毒感染检测及鉴定方法
摘要 本发明提供一种基于宏基因组学的病毒感染检测鉴定技术。基于宏基因组学的病毒感染检测鉴定技术包括以下四个部分:样本制备、高通量测序、生物信息学分析、结果复核。样本制备过程根据基于宏基因组学的病毒感染检测技术的要求和不同类型检测样本的特点从检测样本中有效提取或富集病毒核酸并建成可供二代测序仪使用的核酸库;高通量测序对样本制备步骤提供的核酸库进行测序以获得充分的高质量的核酸序列信息;生物信息学分析通过对高通量测序提供的大量、高质量核酸序列进行分析进而获得样本核酸提示的病毒组成信息;结果复核部分综合生物信息分析结果和其他信息如技术对照等进行全面研判,最终确定备选的感染病毒,并利用其他技术如PCR进行复核。
申请公布号 CN105112569A 申请公布日期 2015.12.02
申请号 CN201510583787.3 申请日期 2015.09.14
申请人 中国医学科学院病原生物学研究所 发明人 金奇;任仙文;杨剑;胡永峰;杨帆
分类号 C12Q1/70(2006.01)I;C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12Q1/70(2006.01)I
代理机构 北京华科联合专利事务所(普通合伙) 11130 代理人 王为;孟旭
主权项 一种基于宏基因组学的病毒感染检测方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)样本制备:基于微量、痕量待检测样本富集、提取病毒核酸构建可用于高通量测序的核酸库;(2)高通量测序:设定辅助基于宏基因组学技术的病毒感染检测的内参、对照;(3)生物信息学分析:本系统的主体部分,从高通量测序数据中准确分析样本中的物种组成,包括远缘未知的病毒组成;(4)结果复核:综合多方面信息,对生物信息学分析结果就行遴选、复核。
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