发明名称 |
一种血浆中游离的目标DNA低频突变富集测序方法 |
摘要 |
本发明提供了一种血浆中游离的目标DNA低频突变富集测序方法,包括血浆DNA提取与文库构建、通用文库TT COLD PCR扩增富集、探针富集捕获、捕获产物PCR及上机测序、正反双链纠错低频信息分析,具体为基于通用引物进行TT COLD PCR对所有类型变异实现第一级突变富集扩增;设计富集探针芯片,针对热点变异将人基因组参考序列hg19设计的探针替换为基于突变碱基设计的探针,其他位点探针不变,进行第二级富集捕获;基于文库构建中的插入DNA两端12bp自身序列作为标签进行正反双链纠错比对,提高数据利用率,实现低频精确检测。本发明方法操作简便,实用性强,可以对0.01%低频变异具有高特异性检测。 |
申请公布号 |
CN105063208A |
申请公布日期 |
2015.11.18 |
申请号 |
CN201510487759.1 |
申请日期 |
2015.08.10 |
申请人 |
北京吉因加科技有限公司 |
发明人 |
吕小星;易鑫;赵美茹;管彦芳;刘涛;杨玲 |
分类号 |
C12Q1/68(2006.01)I |
主分类号 |
C12Q1/68(2006.01)I |
代理机构 |
北京路浩知识产权代理有限公司 11002 |
代理人 |
王文君 |
主权项 |
一种血浆中游离的目标DNA低频突变富集测序方法,包括以下步骤:(1)血浆中游离的目标DNA的提取与文库构建;(2)通用文库TT‑COLD PCR扩增富集;(3)探针富集捕获、杂交捕获产物的扩增与上机测序;(4)正反双链纠错低频信息分析。 |
地址 |
102206 北京市昌平区北清路生命科学园北大医疗产业园2号楼5层 |