发明名称 一种血浆中游离的目标DNA低频突变富集测序方法
摘要 本发明提供了一种血浆中游离的目标DNA低频突变富集测序方法,包括血浆DNA提取与文库构建、通用文库TT COLD PCR扩增富集、探针富集捕获、捕获产物PCR及上机测序、正反双链纠错低频信息分析,具体为基于通用引物进行TT COLD PCR对所有类型变异实现第一级突变富集扩增;设计富集探针芯片,针对热点变异将人基因组参考序列hg19设计的探针替换为基于突变碱基设计的探针,其他位点探针不变,进行第二级富集捕获;基于文库构建中的插入DNA两端12bp自身序列作为标签进行正反双链纠错比对,提高数据利用率,实现低频精确检测。本发明方法操作简便,实用性强,可以对0.01%低频变异具有高特异性检测。
申请公布号 CN105063208A 申请公布日期 2015.11.18
申请号 CN201510487759.1 申请日期 2015.08.10
申请人 北京吉因加科技有限公司 发明人 吕小星;易鑫;赵美茹;管彦芳;刘涛;杨玲
分类号 C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 代理人 王文君
主权项 一种血浆中游离的目标DNA低频突变富集测序方法,包括以下步骤:(1)血浆中游离的目标DNA的提取与文库构建;(2)通用文库TT‑COLD PCR扩增富集;(3)探针富集捕获、杂交捕获产物的扩增与上机测序;(4)正反双链纠错低频信息分析。
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