发明名称 一种用于核酸单碱基改变的核酸反应理论分析方法
摘要 本发明涉及一种用于核酸单碱基改变的核酸反应理论分析方法,包括:(1)计算互补反应和错配反应的标准焓变化量Δ<sub>r</sub>H和标准熵变化量Δ<sub>r</sub>S;(2)穷举计算出所有单碱基改变的焓变化量ΔΔH与熵变化量ΔΔS,得到核酸单碱基改变的焓变化量与熵变化量数据表;(3)通过查阅上述数据表得到任意一种单碱基改变的焓变与熵变数据,同时计算出在任意温度和盐度下该单碱基改变引起的反应自由能变化量ΔΔG,从而指导核酸反应设计。本发明查表方便;使用简单;能够用于任何涉及单碱基改变的核酸反应理论分析;有望促进单碱基改变检测探针涉及以及其他核酸反应领域的理论分析与设计。
申请公布号 CN105046104A 申请公布日期 2015.11.11
申请号 CN201510397820.3 申请日期 2015.07.08
申请人 中国科学院上海微系统与信息技术研究所 发明人 毛红菊;武振华;金庆辉;赵建龙
分类号 G06F19/18(2011.01)I 主分类号 G06F19/18(2011.01)I
代理机构 上海泰能知识产权代理事务所 31233 代理人 黄志达
主权项 一种用于核酸单碱基改变的核酸反应理论分析方法,包括:(1)计算参与互补反应和错配反应中每一种核酸分子的标准焓ΔH与标准熵ΔS;并根据此计算出互补反应和错配反应的标准焓变化量Δ<sub>r</sub>H和标准熵变化量Δ<sub>r</sub>S;(2)两个反应的Δ<sub>r</sub>H和Δ<sub>r</sub>S分别相减,得到相应的单碱基改变引起的焓变化量ΔΔH与熵变化量ΔΔS;穷举计算出所有单碱基改变的焓变化量ΔΔH与熵变化量ΔΔS,得到核酸单碱基改变的焓变化量与熵变化量数据表;(3)通过查阅上述数据表得到任意一种单碱基改变的焓变与熵变数据,同时计算出在任意温度和盐度下该单碱基改变引起的反应自由能变化量ΔΔG,从而指导核酸反应设计。
地址 200050 上海市长宁区长宁路865号5号楼505室