发明名称 生物病毒序列免疫位点快速搜寻方法
摘要
申请公布号 TWI507908 申请公布日期 2015.11.11
申请号 TW103111788 申请日期 2014.03.28
申请人 朝阳科技大学 发明人 杨文广;王舜德;胡裕仁;周宽基
分类号 G06F19/18;C12Q1/68 主分类号 G06F19/18
代理机构 代理人 高玉骏 台北市松山区南京东路3段248号7楼;杨祺雄 台北市松山区南京东路3段248号7楼
主权项 一种生物病毒序列免疫位点快速搜寻方法,适用一目标生物病毒序列,该目标生物病毒序列包括多个基因段,该方法包含下列步骤:(A)提供多个与该目标生物病毒序列相关的相关生物病毒序列,每一相关生物病毒序列相对应地包括该等基因段;(B)根据该目标生物病毒序列的该等基因段中至少一者,及该等相关生物病毒序列中相对应的该等基因段,藉由一第一分群演算法输出一第一关系图,并藉由一第二分群演算法输出一第二关系图,该第一关系图包括一对应该目标生物病毒序列的基因段的目标端点,及多个分别对应该等相关生物病毒序列的基因段的相关端点,该第二关系图包括一对应该目标生物病毒序列的基因段的目标端点,及多个分别对应该等相关生物病毒序列的基因段的相关端点;(C)由该第一关系图中与该目标端点邻近的该等相关端点中至少一者,决定一包括该目标生物病毒序列的基因段及该等相关生物病毒序列的基因段中至少一者的第一生物病毒序列基因段集合,并由该第二关系图中与该目标端点邻近的该等相关端点中至少一者,决定一包括该目标生物病毒序列的基因段及该等相关生物病毒序列的基因段中至少一者的第二生物病毒序列基因段集合; (D)根据该第一生物病毒序列基因段集合及该第二生物病毒序列基因段集合,决定一待测生物病毒序列基因段集合;及(E)对该待测生物病毒序列基因段集合中的该目标生物病毒的基因段及该等相关生物病毒序列的基因段进行比对,以决定至少一免疫位点。
地址 台中市雾峰区吉峰东路168号