发明名称 一种克服信号失真的肿瘤细胞异常通路识别方法
摘要 本发明提供一种克服信号失真的肿瘤细胞异常通路识别方法,包括:利用非负矩阵分解算法对基因表达谱图像矩阵进行通路解构,得到通路表达谱矩阵;根据接受者操作特性曲线和所述通路表达谱矩阵,绘制出每条通路的活性异常曲线;根据所述每条通路的活性异常曲线,计算出每条通路的活性异常值;将每条通路的活性异常值与预设阈值进行比较,当其活性异常值高于预设阈值时,则该通路为肿瘤细胞活性异常通路。本发明克服了传统方法对通路活性建模的失真缺陷,消除了通路关联噪声对通路活性评估的影响,具有更好的肿瘤细胞异常通路检测精度,稳定性与可靠性。本发明可用于药物研发、个性化用药中的药物靶标的检测与识别。
申请公布号 CN105046110A 申请公布日期 2015.11.11
申请号 CN201510375372.7 申请日期 2015.06.28
申请人 中国科学院合肥物质科学研究院 发明人 王红强
分类号 G06F19/24(2011.01)I 主分类号 G06F19/24(2011.01)I
代理机构 合肥天明专利事务所 34115 代理人 宋倩;奚华保
主权项 一种克服信号失真的肿瘤细胞异常通路识别方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)利用非负矩阵分解算法对基因表达谱图像矩阵进行通路解构,得到通路表达谱矩阵;(2)根据接受者操作特性曲线和所述通路表达谱矩阵,绘制出每条通路的活性异常曲线;(3)根据所述每条通路的活性异常曲线,计算出每条通路的活性异常值;(4)将每条通路的活性异常值与预设阈值进行比较,当其活性异常值高于预设阈值时,则该通路为肿瘤细胞活性异常通路。
地址 230031 安徽省合肥市蜀山湖路350号