发明名称 一种鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼的方法
摘要 本发明一种鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼的方法,提供一种具有多态性高、遗传稳定、检测成功率高、便于广泛使用等优点的分子标记方法,能够快速准确地鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼。根据遗传纯合度的差异,从14个SSR标记中筛选出了5个在雌核发育群体与野生群体中扩增稳定、条带清晰、多态性和遗传纯合度差异较大SSR。由于雌核发育群体中遗传纯合度大大提高,SSR在其体内扩增的等位基因数目也会减少。统计分析发现,这5个SSR在普通草鱼体内扩增的实际等位基因数目为8-10个,而在雌核发育草鱼体内扩增的等位基因数目为5-7个,通过比较等位基因数即可鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼,其准确率的理论值可达99.92%。
申请公布号 CN103993081B 申请公布日期 2015.11.04
申请号 CN201410209290.0 申请日期 2014.05.16
申请人 中国水产科学研究院珠江水产研究所;佛山市南海百容水产良种有限公司 发明人 全迎春;韩林强;白俊杰;姜鹏;于凌云;樊佳佳;马冬梅;李胜杰;胡重江
分类号 C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 广州弘邦专利商标事务所有限公司 44236 代理人 张钇斌
主权项 一种鉴别雌核发育草鱼与普通草鱼的方法,其特征在于其具体步骤如下:(1)取待测草鱼尾鳍,利用酚‑氯仿抽提法提取基因组DNA;(2)以步骤(1)中制得的基因组DNA溶液为模板,用5对微卫星引物对分别进行PCR扩增,制得PCR扩增产物,其中的5对微卫星引物序列如下:23426:AAGGAACAGCATAAACCGAAAT GGAACCAAGCATCTGAAACTG 25085:TGTATCAGTAGTAGGCGGTTTA GTGTCGCTACCTCGCTAT 4703:AAGTGAGACTATGCTGATAAAACCG ATTGAAACAGATGCCTGCTTG HLJC148:CAGACGGATGGATGGATG CTTTCAAAATGTGGAGTCTTGC30977:AAAATCCCAGTGAGACAATC ATCCCATAATGCCTTGC;(3)将步骤(2)的PCR产物用12%的非变性聚丙烯酰胺凝胶进行电泳分离,10V/cm电泳2h,用硝酸银溶液染色,氢氧化钠显色液显色,拍照记录电泳结果;(4)根据步骤(3)的电泳图谱得到所述5个SSR标记在待测体内扩增的等位基因数,在5‑7个之间则为雌核发育草鱼,在8‑10个之间则为普通草鱼。
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