CDKN1A基因突变检测特异性引物和液相芯片

摘要

本发明公开了一种CDKN1A基因突变检测液相芯片和特异性引物，该液相芯片主要包括有：每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成的ASPE引物，所述特异性引物序列为：针对A7358T位点的SEQ ID NO.15及SEQ ID NO.16，针对C98A位点的SEQ ID NO.17及SEQ ID NO.18，针对G70A位点的SEQ ID NO.19及SEQ ID NO.20，针对C258T位点的SEQ ID NO.21及SEQ ID NO.22，针对T3745C位点的SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24，针对G2763A位点的SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26，和/或针对C4008T位点的SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28；有不同anti-tag序列包被的微球；扩增引物。本发明所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100％，实现多个突变位点的野生型和突变型并行检测。

主权项

一种CDKN1A基因突变检测液相芯片，其特征是，包括有：(A).针对CDKN1A基因不同突变位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物对：每条ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为：针对A7358T位点的SEQ ID NO.15及SEQ ID NO.16，针对C98A位点的SEQ ID NO.17及SEQ ID NO.18，针对G70A位点的SEQ ID NO.19及SEQ ID NO.20，针对C258T位点的SEQ ID NO.21及SEQ ID NO.22，针对T3745C位点的SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24，针对G2763A位点的SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26，和/或针对C4008T位点的SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28；所述tag序列选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.14；(B).有不同anti‑tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球，所述anti‑tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti‑tag序列选自SEQ ID NO.29～SEQ ID NO.42，且所述anti‑tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对；(C).用于扩增出需要检测的、具有相应突变位点的目标序列的引物；所述扩增引物为：针对A7358T位点的SEQ ID NO.43及SEQ ID NO.44，针对C98A位点的SEQ ID NO.45及SEQ ID NO.46，针对G70A位点的SEQ ID NO.47及SEQ ID NO.48，针对C258T、C4008T位点的SEQ ID NO.49及SEQ ID NO.50，针对T3745C位点的SEQ ID NO.51及SEQ ID NO.52，和/或针对G2763A位点的SEQ ID NO.53及SEQ ID NO.54。