发明名称 |
一种基于遗传物质特异性的肿瘤细胞药物敏感性评估方法 |
摘要 |
本发明提供一种基于遗传物质特异性的肿瘤细胞药物敏感性评估方法,包括:将肿瘤细胞样本集分割为训练样本子集和测试样本子集;采用训练样本子集训练并获得不同参数条件下的肿瘤细胞药物IC50值极限学机预测模型集合;采用测试样本子集逐个测试所述预测模型,选择性能最佳的预测模型作为肿瘤细胞药物敏感性评估模型;计算待测肿瘤细胞的药物敏感性评估值。本发明实现了在生物遗传水平上的肿瘤细胞药物敏感性评估,同时药物IC50值的使用能够避免人工主观性影响,使得药物敏感性判别更加客观、可靠,采用极限学机学无需迭代,待调节参数少且能保证全局最优,使得肿瘤细胞药物敏感性检测更加方便快捷、高效实用。 |
申请公布号 |
CN105005693A |
申请公布日期 |
2015.10.28 |
申请号 |
CN201510402191.9 |
申请日期 |
2015.07.08 |
申请人 |
中国科学院合肥物质科学研究院 |
发明人 |
王红强;靖高见 |
分类号 |
G06F19/00(2011.01)I |
主分类号 |
G06F19/00(2011.01)I |
代理机构 |
合肥天明专利事务所 34115 |
代理人 |
宋倩;奚华保 |
主权项 |
一种基于遗传物质特异性的肿瘤细胞药物敏感性评估方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)按一定比例将肿瘤细胞样本集分割为训练样本子集和测试样本子集,所述肿瘤细胞样本集数据包括各个肿瘤细胞样本的基因突变谱和药物IC50值;(2)采用训练样本子集训练并获得不同参数条件下的肿瘤细胞药物IC50值极限学习机预测模型集合;(3)采用测试样本子集逐个测试所述肿瘤细胞药物IC50值极限学习机预测模型,选择性能最佳的肿瘤细胞药物IC50值极限学习机预测模型作为肿瘤细胞药物敏感性评估模型;(4)将待测肿瘤细胞的基因突变谱输入所述肿瘤细胞药物敏感性评估模型,计算得到所述待测肿瘤细胞的药物IC50值,作为其药物敏感性评估值。 |
地址 |
230031 安徽省合肥市蜀山湖路350号 |