发明名称 |
一种核酸测序信息处理系统及方法 |
摘要 |
本发明涉及信息处理领域,提供了一种核酸测序信息处理系统及方法。所述系统包括:用于将每条核酸序列片段进行分段建立短片段的短片段建立单元;用于根据短片段的长度建立参考序列索引并存储短片段,得数据库的数据库建立单元,用于将每条核酸序列片段分段建立的短片段分别单独在数据库中进行匹配的序列匹配单元。其中,还包括一种基于该系统的方法。本发明的技术方案能够实现核酸序列片段准确快速的匹配。 |
申请公布号 |
CN102682226B |
申请公布日期 |
2015.09.30 |
申请号 |
CN201210112811.1 |
申请日期 |
2012.04.18 |
申请人 |
盛司潼 |
发明人 |
盛司潼 |
分类号 |
G06F19/22(2011.01)I |
主分类号 |
G06F19/22(2011.01)I |
代理机构 |
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代理人 |
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主权项 |
一种核酸测序信息的处理系统,其特征在于,所述系统包括:短片段建立单元、数据库建立单元和序列匹配单元;所述短片段建立单元,用于将每条核酸序列片段进行分段建立短片段,并将每条核酸序列片段分段所得的短片段发给数据库建立单元和序列匹配单元;所述数据库建立单元,用于根据短片段的长度建立并存储参考序列索引,得数据库;所述序列匹配单元,用于将每条核酸序列片段分段建立的短片段分别单独在数据库中进行匹配,得匹配结果;所述短片段建立单元包括第一决策模块和第一分段模块;所述第一决策模块,用于获取最短的一条核酸序列片段,并将该核酸序列片段和该核酸序列片段的碱基个数发给第一分段模块;所述第一分段模块,用于对最短的一条核酸序列片段进行分段得多条短片段,并完成其他核酸序列片段的分段建立短片段;所述其他核酸序列的分段方式与最短的一条核酸序列片段分段方式相同。 |
地址 |
518057 广东省深圳市南山区高新区科技中二路软件园二期11栋4楼北402室 |