利用双S形的曲率分析的PCR肘确定

摘要

本发明提供用于确定S形或生长型曲线中的例如肘值的特征过渡值、例如PCR扩增曲线中的周期阈值(Ct)的系统和方法。具有通过Levenberg-Marquardt(LM)回归方法所确定的参数的双S形函数被用于找到拟合PCR数据集的曲线的近似。一旦已经确定参数，就可以利用一个或多个所确定的参数来使曲线标准化。在标准化之后，处理标准化曲线以确定曲线在沿着该曲线的一些或所有点处的曲率，例如以产生表示曲率对周期数的数据集或图。出现最大曲率的周期数对应于Ct值。该Ct值然后被返回并且可以被显示或另外被用于进一步的处理。

主权项

一种用于测量聚合酶链反应(PCR)扩增的效率的方法，该方法包括以下步骤： 在扩展反应过程中测量荧光信号的荧光强度值，其中这些荧光信号被用于检测扩增； 针对要被分析的所有反应以及参考核酸确定所规定的荧光信号阈值以及达到该阈值所需要的周期(Ct)数，其中生长曲线的周期(Ct)阈值这样来确定： 接收表示生长曲线的数据集，所述数据集包括多个数据点，每一个数据点都具有一对坐标值； 通过将Levenberg Marquardt(LM)回归方法应用于双S形函数以确定该函数的参数来计算拟合所述数据集的曲线的近似； 利用所确定的参数使所述曲线标准化，以生成标准化曲线；以及 处理所述标准化曲线，以确定具有最大曲率的点，其中所述具有最大曲率的点表示生长曲线的基线区域的终点， 通过将针对要被分析的每个反应的周期阈值(Ct)与所述参考核酸的周期阈值(Ct)相比较来确定该聚合酶链反应(PCR)扩增的效率。