发明名称 一种肿瘤标志物-血清蛋白指纹图谱的检测方法
摘要 本发明属生物技术领域,涉及一种肿瘤标志物-血清蛋白指纹图谱的检测方法。具体涉及血清蛋白质的表面增强激光解析离子化-飞行时间质谱测定和特异性蛋白峰比较识别的方法,包括血清样本的采集标准,化学芯片的选择、处理和阅读,测定条件的优化;PVTT判别模式及验证。经血清样品检测重复性分析;比较PVTT和无PVTT组显示有显著差异蛋白峰;获得的血清蛋白质指纹图谱中发现有判别意义的蛋白质峰;通过建立的决策树模型能显著地区分两组患者,敏感性为75.8%(25/33),特异性为82.3%(51/62)。本发明进一步可用于无创鉴别和预测肿瘤的转移。还可用于原发性肝癌病人术后肝癌转移复发倾向的预测及筛选。
申请公布号 CN1851455B 申请公布日期 2010.11.10
申请号 CN200510025341.5 申请日期 2005.04.22
申请人 复旦大学附属中山医院 发明人 刘银坤;黄成;崔杰锋;樊嘉;周俭;汤钊猷
分类号 G01N30/86(2006.01)I;G01N33/72(2006.01)I 主分类号 G01N30/86(2006.01)I
代理机构 上海正旦专利代理有限公司 31200 代理人 包兆宜
主权项 一种肿瘤标志物-血清蛋白指纹图谱的检测方法,其特征是采用表面增强激光解吸/电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,包括血清样本的采集标准,化学芯片的选择、处理和阅读,测定条件的优化;建立判别模式及验证步骤,所述的芯片阅读步骤,其参数设置为,阅读条件:a.选用激光能量(Intensity)为185,b.敏感性(Sensitivity)为8,c.每孔都实行20次激光轰击,d.测定范围:蛋白质m/z(质荷比)在1500~30000Da,e.all-in-1肽谱进行标准化,所述的建立判别模式步骤包括通过血清蛋白指纹谱比较区分肝癌转移的、有意义的血清差异蛋白质,和通过具有肝癌转移判别意义的血清蛋白质建立决策树模型;所述的血清蛋白指纹谱比较区分肝癌转移的、有意义的血清差异蛋白质为:M/Z 9353、9415、8901、8773、8697、8569、7773、3478、3380、2766、2745、2022、1744、1725、1374和1314;所述的具有转移判别意义的血清蛋白质为:M/Z 9415、8901、8773、3478、2766、2745和2022。
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