猪干扰素α的一个SNP标记及应用

摘要

本发明属于猪分子标记制备与应用技术领域，具体涉及猪干扰素α的一个SNP分子标记，该分子标记是从猪TLR6基因外显子中克隆得到，本发明还包括猪TLR6基因外显子序列突变位点的检测方法与应用。本发明通过制备得到一种猪干扰素(IFN)-α免疫性状相关的SNP分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，在序列表SEQ ID NO:1第587bp处存在一个A/G碱基突变，该突变导致PCR-BtsI-RFLP多态性。本发明还公开了该分子标记的制备方法及其在猪干扰素α关联分析中的应用。

主权项

猪干扰素α的一个SNP分子标记，其核苷酸序列如下所示： CCCAGAGAGCCGCCAAGCAGGTTAGCAACACACAACCACAGTTCTTTGCTAACAAGGTCTGTATTGCCTTTCTGGCACCAGCCACTTGTATAATTGGAAAAAAATAACATTAAATTATGGGGACAGAAATGATTCTGATAGTGAATAAAGAACTCATTGAGATTTTGTGTTTACTAAGGAGATGTTTCAGAACAGTCATCCAATCTTTATACATCTTTGTTTTCCATCCAATCTTTATATATCGTAACATATATTTCTAGAATTTGGATGCCTAGCAAGATGTTCTGAAGAACAGCAGCAACCCTCTGGGGGATGGTAACTTCAACATCATGAGCAAAGACAAAGAACCTACTGTCATAAGCCTTCATTCTGTGTATGTCATGACCTTAGTATGGGGAACCCTAATCCAGTTCTCTGAAGAAAGTGAATTTGTGGTAGACAAGTAGTCAAAAATAGGCCTTACTCGTGTTGCCACCCCAAACCAAAGTCTTAGATGTGTCTCAAAACTTCATAACTGAGCTTCACCTCTCTGACATCAGCTTTCTCTCGCAGCTGACGGTTTTGAGACTTTCCCAGAATAGGATGCR[A/G]GTGCCTTGATATCAGTGTTTTCAAGTTCAATCAGGATTTGGAATATTTGGATTTATCTCACAATCAGTTGCAGACAATCTTGTGCCATCCCATCACCAGCCTCAAGCATTTGGACCTCTCATTCAATGACTTTGAAGCCCTGCCCATATGTAAGGAGTTTGGCAACTTGACACAACTGAATTTCTTGGGATTAAGTGCTACAAAGTTACAGCAATTAGATCTACTACCAATTGCTCACTTGCATCTAAGTTGCATCCTTCTGGATTTGGAACGTTATTACATGAAAGAAAATGAGAAAGAAAGTCTTCAAATTCTGAACACAAAGAAACTTCACCTGGTCTTTCATCCAAATAGCTTCTTCTCTGTCCAAGTAAACATATCGGTTAAGAGTGTAGGGTGTTTACAACTGGCTAATATTAAACTGAGTGATGACAACTGTCAGGTTTTCATTACATTTTTATTGGAACTCACTCAAGGGCCAACCTTACTAAATTTTACGCTCAACCATGTGG 上述序列中的587位中的R是A或G，导致PCR‑BtsI‑RFLP多态性 。