| 摘要 |
1. Способ идентификации модифицированного остатка цитозина в образце нуклеотидной последовательности, включающий:(i) обеспечение популяции полинуклеотидов, содержащих исследуемую нуклеотидную последовательность,(ii) окисление или восстановление первой части указанной популяции,(iii) обработку окисленной или восстановленной первой части указанной популяции и второй части указанной популяции бисульфитом,(iv) секвенирование полинуклеотидов в первой и второй частях популяции после этапов ii) и iii) с получением первой и второй нуклеотидных последовательностей, соответственно, и(v) идентификацию остатка в первой и второй нуклеотидных последовательностях, соответствующего остатку цитозина в исследуемой нуклеотидной последовательности.2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что остатки, идентифицированные в первой и второй нуклеотидных последовательностях, указывают на модифицированный цитозин в соответствующем положении исследуемой нуклеотидной последовательности.3. Способ по п. 1, отличающийся тем, что модифицированный цитозин представляет собой 5-метилцитозин (5mС), 5-гидроксиметилцитозин (5hmC) или 5-формилцитозин (5fC).4. Способ по пункту 1, отличающийся тем, что первую часть указанной популяции окисляют на этапе ii).5. Способ по п. 4, отличающийся тем, что указанное окисление обеспечивает селективное окисление остатков 5-гидроксиметилцитозина.6. Способ по п. 4, отличающийся тем, что этап ii) включает множественные этапы окисления и очистки первой части полинуклеотидов.7. Способ по п. 4, отличающийся тем, что указанную первую часть окисляют с использованием химического окислителя.8. Способ по п. 4, отличающийся тем, что указанную |
