构建芥菜SSR遗传图谱的引物组及遗传图谱的构建方法

摘要

本发明属于生物技术领域，涉及构建芥菜SSR遗传图谱的引物组及遗传图谱的构建方法。其是基于榨菜转录组序列信息开发得到的EST-SSR引物组，所述引物组包含112对多态性引物。以茎膨大的“浙桐一号”多年自交系为母本，以茎不膨大的“邱隘大叶黄种雪里蕻”多年自交系分蘖芥为父本，通过杂交获得F₁后代，然后F₁自交获得F₂作图群体。利用112对多态性引物通过两亲本及200株F₂群体，构建芥菜遗传图谱。本发明构建了第一个我国特有的芥菜类蔬菜种质的SSR遗传图谱，为进一步进行QTL定位以及分子标记辅助育种提供了依据。

主权项

构建芥菜SSR遗传图谱的引物组，其特征在于，包括以下112对引物：BjSSR0001正向引物SEQ ID NO.1：AAATCCCCAAAAACCTAGAG反向引物SEQ ID NO.113：CTCATCCATCTCCTCGTCTBjSSR0002正向引物SEQ ID NO.2：CTTCGTTTGCGCGTTTT反向引物SEQ ID NO.114：ATGATGGTCTCCTTTTGTTGBjSSR0004正向引物SEQ ID NO.3：AAGAAGTCGAGTAGTCGCAG反向引物SEQ ID NO.115：AAACGAACAATACTTCCCGBjSSR0008正向引物SEQ ID NO.4：ATGGAGCACATCTCAAAGAC反向引物SEQ ID NO.116：CTTTTGTTGTGATGACCCTTBjSSR0019正向引物SEQ ID NO.5：GAAACACAAACGCAGCA反向引物SEQ ID NO.117：ACAGGCATTGTAGGAGACACBjSSR0023正向引物SEQ ID NO.6：TAAGCAGAGAAAGAAATGGG反向引物SEQ ID NO.118：AGATCTCTGGAGTTGGGAGTBjSSR0166正向引物SEQ ID NO.7：GAACAACAACTCATCCACCT反向引物SEQ ID NO.119：AGACTCGTTATTGATGCTGGBjSSR0234正向引物SEQ ID NO.8：ATTCTAATCACAACAACCGC反向引物SEQ ID NO.120：ATGTAGTAGCCAAGGTGGTGBjSSR0312正向引物SEQ ID NO.9：AGAAGCTTGGTAAGACGACA反向引物SEQ ID NO.121：ATGCTCGAAGCTTTCTTATGBjSSR0364正向引物SEQ ID NO.10：ATCCCCTCGTTAAAACTCTC反向引物SEQ ID NO.122：GATGTTGAGGAGGTACTGGABjSSR0486正向引物SEQ ID NO.11：TTCCAAATCATCTTCTCACC反向引物SEQ ID NO.123：CGTCCAACACAACAAACATABjSSR0513正向引物SEQ ID NO.12：ATCAAGAAAATGGAGCAAGA反向引物SEQ ID NO.124：CTTCACTCTTGAACCTCTGGBjSSR0612正向引物SEQ ID NO.13：TCGATTCTGGTCTTGAGTTT反向引物SEQ ID NO.125：GAGTTGTAGACCGGATCAAABjSSR0613正向引物SEQ ID NO.14：TGAATTTGATCTCCGGTAAC反向引物SEQ ID NO.126：ATTGCTGATCATACGGAAACBjSSR0678正向引物SEQ ID NO.15：TCAGCTACGGATAGAAGAGC反向引物SEQ ID NO.127：GGACTCACATTGATCGTCTTBjSSR0723正向引物SEQ ID NO.16：TAATGGCTTTGAAACTCTGC反向引物SEQ ID NO.128：GGAAAGGAAGAGGTTCTTGTBjSSR0731正向引物SEQ ID NO.17：CTCAAGAGGCTCAACACTTC反向引物SEQ ID NO.129：TCCATTGCAACAATTAGACABjSSR0806正向引物SEQ ID NO.18：GATGAAGAGAGAAGCGAAGA反向引物SEQ ID NO.130：TCCGTGAAGAAGCTAATGATBjSSR0891正向引物SEQ ID NO.19：GTTCTGAACGTTCTGGCTAC反向引物SEQ ID NO.131：CATACACACGGTCTGATGAABjSSR0913正向引物SEQ ID NO.20：AATCCTCAGACCTCAAAACA反向引物SEQ ID NO.132：GTATTCCTCGTAATCGTTGGBjSSR0942正向引物SEQ ID NO.21：AATCTGGCAGAACTCAGAGA反向引物SEQ ID NO.133：TCGGTGTAAGCCATATCTTTBjSSR0967正向引物SEQ ID NO.22：GACCTCCTCCTGAAGTTTCT反向引物SEQ ID NO.134：GCTGCAACTCACTTCTCTTTBjSSR1018正向引物SEQ ID NO.23：CAGTTGTGTCCATGTACGAG反向引物SEQ ID NO.135：TTCCGATGTCTGATAACTCCBjSSR1040正向引物SEQ ID NO.24：ACAAACAAATGGAAGACGAG反向引物SEQ ID NO.136：AGATCGGATTTGATCTTGGBjSSR1215正向引物SEQ ID NO.25：AGGGTGAGATACGACGAGTA反向引物SEQ ID NO.137：CTTTCGTTTGGTCATTCATCBjSSR1289正向引物SEQ ID NO.26：CGAGAGCCTAGATCTGAGAA反向引物SEQ ID NO.138：TAAACAAACGCCTTACCTTCBjSSR1365正向引物SEQ ID NO.27：TGAAAGTAGGCAACCGTATT反向引物SEQ ID NO.139：CTCGCTTTACTCTCTGCAATBjSSR1448正向引物SEQ ID NO.28：GAGGTTGTTTCTTTTCCCTT反向引物SEQ ID NO.140：GAATCAGCTATTCATCGGAGBjSSR1474正向引物SEQ ID NO.29：ACTTTCCCTTACAATCCTCC反向引物SEQ ID NO.141：GACTAGCAGCCTTCATCATCBjSSR1528正向引物SEQ ID NO.30：CGTTCTCTTCACTATGCTCC反向引物SEQ ID NO.142：TCACATAGCCCATAAACACABjSSR1594正向引物SEQ ID NO.31：AACAAACCTCACAAACCAAC反向引物SEQ ID NO.143：ATTCTTCCACTCCCTTCTTCBjSSR1612正向引物SEQ ID NO.32：AGGAGGAGGAAGAAGACAAC反向引物SEQ ID NO.144：TCGTTTGATCGAACTTACCTBjSSR1764正向引物SEQ ID NO.33：AAAGTCATGAAGAATGTGGG反向引物SEQ ID NO.145：AGAAGCTTGTCTCAACATGGBjSSR1799正向引物SEQ ID NO.34：GAAGTTTCCAACAAAACAGG反向引物SEQ ID NO.146：GATTATGAACCACCGAGAGABjSSR1811正向引物SEQ ID NO.35：TCACAACGCAAAATAAACAA反向引物SEQ ID NO.147：CTTTCCATCCCATGTGTAGTBjSSR1812正向引物SEQ ID NO.36：TCAATATACAATCTTCGTGACTCT反向引物SEQ ID NO.148：CAATAGGGATCATAACCGTCBjSSR1813正向引物SEQ ID NO.37：GCTGCTATAGCTGGTCACTC反向引物SEQ ID NO.149：TCATCGTTTGGTTCTTCTTTBjSSR1831正向引物SEQ ID NO.38：ACTTGTTTCACTTCCAGCAT反向引物SEQ ID NO.150：TTGTTTTGATTGTTATCCCCBjSSR1885正向引物SEQ ID NO.39：ACCACAAAAACACACCAAAC反向引物SEQ ID NO.151：TCTCACTCCTCTATAACGGGBjSSR1926正向引物SEQ ID NO.40：TCCAGCAGCTTATTACCAGT反向引物SEQ ID NO.152：GCACTTTAGCTGTTCTTGGTBjSSR1934正向引物SEQ ID NO.41：TTTTCTCTTACCGAACCAAA反向引物SEQ ID NO.153：GTTTGAAGGAAGAAGTGTCGBjSSR1950正向引物SEQ ID NO.42：CCCTCGTCTTCTTAGGTCTT反向引物SEQ ID NO.154：ATCAACCATTCCAGACATTCBjSSR1970正向引物SEQ ID NO.43：ATATCACCACCACCATTGTT反向引物SEQ ID NO.155：TCCTCCACAATCTCCATTACBjSSR1984正向引物SEQ ID NO.44：GCAATTGCTTTAATCTGTCC反向引物SEQ ID NO.156：GAGGCAGGTATACAGATGCTBjSSR1985正向引物SEQ ID NO.45：GTTCTCCGACGTCTGTTCT反向引物SEQ ID NO.157：TTTCTGGTTTTCGATTTCATBjSSR2017正向引物SEQ ID NO.46：CGTTGATTCCAACAAACC反向引物SEQ ID NO.158：GAGTTGATGAGAGATTTGGCBjSSR2113正向引物SEQ ID NO.47：CCTCAGTTTCAGAATCAAGC反向引物SEQ ID NO.159：TCCGGAAGAGAGAATAACAABjSSR2164正向引物SEQ ID NO.48：TCTCTTATCCTTTGGTCACG反向引物SEQ ID NO.160：GGAAACGAAGACATAAGCTGBjSSR2184正向引物SEQ ID NO.49：GGATTCGTGTTTGAGTTGTT反向引物SEQ ID NO.161：TTCCCAGAAGAAGAAGATCABjSSR2234正向引物SEQ ID NO.50：TACACCGTCTGATTCCATCT反向引物SEQ ID NO.162：GGGTTCGAGATACCACAATABjSSR2235正向引物SEQ ID NO.51：CGCTTACACCTTTCTTGAAT反向引物SEQ ID NO.163：CGAAGTTCAAATTTCCAATCBjSSR2247正向引物SEQ ID NO.52：ACAAGTACAGTGGAGGGATG反向引物SEQ ID NO.164：CAGACCACCTGTTGGTATCTBjSSR2272正向引物SEQ ID NO.53：AAGATCTAGGGTTTCTTCGC反向引物SEQ ID NO.165：CGAAGAGCTTCTGAGTGAATBjSSR2285正向引物SEQ ID NO.54：CAACCTTTCTTTCTTACGCA反向引物SEQ ID NO.166：TTAAGAGAAACCCACCAAAABjSSR2449正向引物SEQ ID NO.55：TGCATAACCACCATAGAACA反向引物SEQ ID NO.167：ATCAAGTGCTGCGTATAGGTBjSSR2450正向引物SEQ ID NO.56：CTCCTCTTCTCCAGAGGATT反向引物SEQ ID NO.168：GAGGAGGAAGGGAAGAGTCBjSSR2464正向引物SEQ ID NO.57：CTCTCGTGGACAGAGAAAAC反向引物SEQ ID NO.169：GATCACTTCACCATTCTGCTBjSSR2519正向引物SEQ ID NO.58：AAGTGGAAGAAGAAGTGGGT反向引物SEQ ID NO.170：CGCTAGGAGAAAGACTCTCABjSSR2669正向引物SEQ ID NO.59：GAAGATGGTGGCAGCTATAC反向引物SEQ ID NO.171：TAAGAAGACAGAGCCAAAGCBjSSR2743正向引物SEQ ID NO.60：GTCGGGTCAGGTTAGTTACA反向引物SEQ ID NO.172：CAGAACCTCCAAAAGTTGAGBjSSR2763正向引物SEQ ID NO.61：CAAACCCATAGAGAAAGACG反向引物SEQ ID NO.173：TCGGAGACGAACTTAGAGAGBjSSR2886正向引物SEQ ID NO.62：TCCCCGCCTCCCTTCAC反向引物SEQ ID NO.174：GTCTCCGAGTAAGACGTCAGBjSSR2910正向引物SEQ ID NO.63：AATCCTATGGCACAGATGAC反向引物SEQ ID NO.175：TGATCTTGGATCGATAGCTTBjSSR2957正向引物SEQ ID NO.64：TCTGAACTCGTCGTCTCTCT反向引物SEQ ID NO.176：TTAAGCACAGTGTTGAGTGCBjSSR3033正向引物SEQ ID NO.65：ATACAGTTTCTGCGATTTGG反向引物SEQ ID NO.177：ACTGCGAGTGAAAGAAGAAGBjSSR3109正向引物SEQ ID NO.66：AAATCAGGAGAGAAAGGGTC反向引物SEQ ID NO.178：AAAGCTGCTTAATTTCGGATBjSSR3137正向引物SEQ ID NO.67：AAGAGATGGATCTTGGTGTG反向引物SEQ ID NO.179：GAATCTTCCTCATCTGCTTGBjSSR3227正向引物SEQ ID NO.68：CTGTTCATCTTCGTCTCCTC反向引物SEQ ID NO.180：ACTTCTCTGTCTTCGGTTGABjSSR3364正向引物SEQ ID NO.69：TTCCCTATTCAGTGATCTGC反向引物SEQ ID NO.181：CAAACCAGCCTCTCTGGBjSSR3426正向引物SEQ ID NO.70：AGATTTTCTCGCGAGTATTG反向引物SEQ ID NO.182：TGAGAGAGAGAGCCTGAGAGBjSSR3445正向引物SEQ ID NO.71：TCAAGCTAAGAGGCTTTCAC反向引物SEQ ID NO.183：GAGACATTGGAACCAACCTABjSSR3488正向引物SEQ ID NO.72：CTGTGATTTCCCAATTTTCT反向引物SEQ ID NO.184：CATTTCTTCTTCAAGATCCGBjSSR3505正向引物SEQ ID NO.73：AGGAGGAGGAGACAGAAGAC反向引物SEQ ID NO.185：ACCAACAGCACAAGAGAAGTBjSSR3613正向引物SEQ ID NO.74：ACAGAGGTTTCCATCATCAG反向引物SEQ ID NO.186：CCTTTTGGTCTGAGTTTCTGBjSSR3652正向引物SEQ ID NO.75：GTGATATTAAATTCGCCGTC反向引物SEQ ID NO.187：CATTGCCATCTCTCTCTCTCBjSSR3690正向引物SEQ ID NO.76：GCGAGTTTTCCTCTTCTTC反向引物SEQ ID NO.188：GATTTCCGATTAGGGTTGTTBjSSR3876正向引物SEQ ID NO.77：AACAGAGCTTAAACCAAACG反向引物SEQ ID NO.189：AACCTCCGAGAAACCGTBjSSR3885正向引物SEQ ID NO.78：ATCGTTAGTAGCACCTCCAA反向引物SEQ ID NO.190：TGTCTTCTCATGTCTCCCTCBjSSR3914正向引物SEQ ID NO.79：CAACCCATCTCTGTTCAAGT反向引物SEQ ID NO.191：CAAGGGACTATCGACGTAAGBjSSR3915正向引物SEQ ID NO.80：AGGGAAGGAAAGTTTGAGAC反向引物SEQ ID NO.192：AGCACAACCCATTTATGTTCBjSSR3969正向引物SEQ ID NO.81：AGTCCCTTTGCTCTTCTTCT反向引物SEQ ID NO.193：TTGGTCTTTGGTCTACCATCBjSSR3988正向引物SEQ ID NO.82：TCTCTATCCCTCACATCTCG反向引物SEQ ID NO.194：AGGAGGATGAAAAGAAGAGGBjSSR4254正向引物SEQ ID NO.83：TACCCACAAGTGAAATCTCC反向引物SEQ ID NO.195：ATCACCTCCACGTACTCAACBjSSR4315正向引物SEQ ID NO.84：AAAACGTTTACAACGGAGAA反向引物SEQ ID NO.196：TTGGATACGCAAAAGAGAATBjSSR4351正向引物SEQ ID NO.85：ACGCAAATTCGATATACACC反向引物SEQ ID NO.197：CGATGATGAAGAAGAGGAAGBjSSR4366正向引物SEQ ID NO.86：ACATTACCACTGTTGAAGCC反向引物SEQ ID NO.198：GGAGCGTTAGATGTGGTTACBjSSR4391正向引物SEQ ID NO.87：AGAGGACGAGAGTGTGAGAA反向引物SEQ ID NO.199：GACTTAGGGCTCTTTGGTTTBjSSR4514正向引物SEQ ID NO.88：TACTATGAAGAGCAGCAGCA反向引物SEQ ID NO.200：ATCTATCGAACGATGACCACBjSSR4587正向引物SEQ ID NO.89：CTCAGCTCTCCTTACTTCCA反向引物SEQ ID NO.201：AGAGGAGGAACCATCGTTAGBjSSR4628正向引物SEQ ID NO.90：ACTTCACGTTGCTCATCTCT反向引物SEQ ID NO.202：AAGAAGCTAACCGTCTTCCTBjSSR4662正向引物SEQ ID NO.91：CATTATCTTCGAAAGACCAAA反向引物SEQ ID NO.203：CGTACTGGTGAGGGTACATCBjSSR4707正向引物SEQ ID NO.92：TCTCTGATCAGGATGGTAGG反向引物SEQ ID NO.204：ATGGTTAGATGATGCTGGTCBjSSR4811正向引物SEQ ID NO.93：GAACTTTCTCAATGCCTGTC反向引物SEQ ID NO.205：GAGAAGTCACCAAAGACGTGBjSSR4854正向引物SEQ ID NO.94：CTTCAGTTCAAACCTTCGAC反向引物SEQ ID NO.206：GTTGATTGATGTTGCTGATGBjSSR4873正向引物SEQ ID NO.95：AGTCCTCTTTCTCAGGGAAC反向引物SEQ ID NO.207：TCTGCAACATTGAGTTCTTGBjSSR4957正向引物SEQ ID NO.96：TGGTGGAAGAAATAATGGTC反向引物SEQ ID NO.208：GAGAGGGTGACAGGAGTACABjSSR5151正向引物SEQ ID NO.97：ATGATAAGAGTTGGAAACGC反向引物SEQ ID NO.209：GTCTCTTCCTTCTCCGTTCTBjSSR5176正向引物SEQ ID NO.98：GATTGCGATGATTTGGTAAT反向引物SEQ ID NO.210：GAGTTCTATGCTTCGGACAGBjSSR5177正向引物SEQ ID NO.99：TGGGTCTCTTCACAAGAATC反向引物SEQ ID NO.211：ATAGATGACCATCAACGGAGBjSSR5206正向引物SEQ ID NO.100：CTACAATTCACCACCTCCAC反向引物SEQ ID NO.212：GGTGAGTACTCTATGCAGGGBjSSR5224正向引物SEQ ID NO.101：CTATAGGCTCCTTCTACGCA反向引物SEQ ID NO.213：TGTTTAGTTGTGTTTCGCTGBjSSR5269正向引物SEQ ID NO.102：ACACAAACCCAAGAACACTC反向引物SEQ ID NO.214：GAGTAGACATAGCTGGGACGBjSSR5270正向引物SEQ ID NO.103：AATCAAGCAAACCTTCTACT反向引物SEQ ID NO.215：TCCAACAAACAAACACAGAABjSSR5340正向引物SEQ ID NO.104：AGGAAGAGAGGCGTAAAAGT反向引物SEQ ID NO.216：TCCTATCTCTCTCCTCCCTCBjSSR5342正向引物SEQ ID NO.105：ACGGATCAACACAAGAAATC反向引物SEQ ID NO.217：ATCACATCATCACCACCTTTBjSSR5411正向引物SEQ ID NO.106：CAGTCTGGTACTCCAAGAGC反向引物SEQ ID NO.218：TATTTGCAGACGAAACCTCTBjSSR5542正向引物SEQ ID NO.107：TAGGTAATGGAAGGAGCAAA反向引物SEQ ID NO.219：TCCTACAACAATGTCACGAABjSSR5854正向引物SEQ ID NO.108：AGCATACTCTTCTTCGACCA反向引物SEQ ID NO.220：GTTGCCATAAACCTGATGATBjSSR5877正向引物SEQ ID NO.109：GAAGAGAGTCAACAACAGCC反向引物SEQ ID NO.221：TTCACTTCGACATCCTTCTTBjSSR5921正向引物SEQ ID NO.110：GTCGCAAGGAATCATCTAAC反向引物SEQ ID NO.222：GTACACAAAGGACCAACCACBjSSR5941正向引物SEQ ID NO.111：AAAAGCTTCTCTTGCTGATG反向引物SEQ ID NO.223：TGCTGAGTCTGTTGCTGTAGBjSSR5990正向引物SEQ ID NO.112：TTCGTTTTAGCGTCTCTCTC反向引物SEQ ID NO.224：GAATTTTTGCAACAGCTTTC。