一种海洋环境α变形菌群落检测基因芯片及其应用

摘要

本发明所要解决的技术问题是提供一种检测海洋环境α变形菌群落的基因芯片及应用，即可平行、快速、高通量的检测海洋环境α变形菌群落，使基因芯片技术更好的应用于海洋环境监测，从而弥补现有技术的不足。本发明芯片所使用的探针可以快速、高通量地对海水中的α变形菌群落进行检测，最大可以检测22个科的α变形菌信息，从而为海洋环境细菌群落的监测提供了有力的技术支持，为建立、健全近岸海域海洋环境质量综合评价体系奠定了坚实的基础。

主权项

一种检测海洋环境α变形菌群落的基因芯片，其特征在于，所述的基因芯片，包括有芯片载体，以及固定在芯片载体上的，用于检测海水中Acetobacteraceae、Beijerinckiaceae、Bradyrhizobiaceae、Brucellaceae、Caulobacteraceae、Cohaesibacteraceae、Erythrobacteraceae、Hyphomicrobiaceae、Hyphomonadaceae、Kordiimonadaceae、Methylobacteriaceae、Methylocystaceae、Parvularculaceae、Phyllobacteriaceae、Rhizobiaceae、Rhodobacteraceae、Rhodobiaceae、rhodospirillaceae、Rickettsiaceae、Sneathiellaceae、Sphingomonadaceae、Xanthobacteraceae菌的探针；其中用于检测Acetobacteraceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:1‑2中的任一种或几种；用于检测Beijerinckiaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:3‑5中的任一种或几种；用于检测Bradyrhizobiaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:6‑8中的任一种或几种；用于检测Brucellaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:9‑10中的任一种或几种；用于检测Caulobacteraceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:11‑13中的任一种或几种；用于检测Cohaesibacteraceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:14‑15中的任一种或几种；用于检测Erythrobacteraceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:16‑17中的任一种或几种；用于检测Hyphomicrobiaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:18‑20中的任一种或几种；用于检测Hyphomonadaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:21‑23中的任一种或几种；用于检测Kordiimonadaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:24‑26中的任一种或几种；用于检测Methylobacteriaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:27‑29中的任一种或几种；用于检测Methylocystaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:30‑31中的任一种或几种；用于检测Parvularculaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:32‑33中的任一种或几种；用于检测Phyllobacteriaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:34‑35中的任一种或几种；用于检测Rhizobiaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:36‑38中的任一种或几种；用于检测Rhodobacteraceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:39‑41中的任一种或几种；用于检测Rhodobiaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:42‑44中的任一种或几种；用于检测rhodospirillaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:45‑47中的任一种或几种；用于检测Rickettsiaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:48‑49中的任一种或几种；用于检测Sneathiellaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:50‑52中的任一种或几种；用于检测Sphingomonadaceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:53‑55中的任一种或几种；用于检测Xanthobacteraceae微生物的核酸探针，其核苷酸序列为SEQ ID NO:56‑57中的任一种或几种。