发明名称 |
一种测试大豆品种实质性派生关系的方法 |
摘要 |
本发明公开了一种测试大豆品种实质性派生关系的方法。该方法包括:获得变异位点;确定测试区域;抽样提取并获得抽样样本的DNA;制备引物;利用所述引物分别对两个抽样样本的DNA进行扩增,分别得到两个待测大豆品种在测试区域的扩增产物用于构建两个待测大豆品种的高通量测序文库;对两个高通量测序文库分别进行高通量测序,分别得到两个所述待测大豆品种的测序片段组;分析两个测序片段组,分别获得两个待测大豆品种基因型;比较两个待测大豆品种基因型,获得待测大豆品种间差异基因型的比例;根据待测大豆品种间差异基因型的比例,判断两个待测大豆品种的实质性派生关系。该方法能够准确、快速且简单地判断待测大豆品种间的实质性派生关系。 |
申请公布号 |
CN104805188A |
申请公布日期 |
2015.07.29 |
申请号 |
CN201510150207.1 |
申请日期 |
2015.03.31 |
申请人 |
农业部科技发展中心;江汉大学 |
发明人 |
陈红;崔野韩;唐浩;杨坤;徐岩;卢新;杨旭红;堵苑苑;杨扬;侯耀华;温雯;邓超;彭海 |
分类号 |
C12Q1/68(2006.01)I |
主分类号 |
C12Q1/68(2006.01)I |
代理机构 |
北京三高永信知识产权代理有限责任公司 11138 |
代理人 |
徐立 |
主权项 |
一种测试大豆品种实质性派生关系的方法,其特征在于,所述方法包括:获得不同大豆品种间的变异位点;通过所述变异位点确定测试区域;分别对两个待测大豆品种进行抽样,提取并获得两个所述待测大豆品种的抽样样本的DNA;制备扩增所述测试区域的引物;利用所述引物分别对两个所述抽样样本的DNA进行扩增,分别得到两个所述待测大豆品种在所述测试区域的扩增产物,所述扩增产物分别用于构建两个所述待测大豆品种的高通量测序文库;对两个所述待测大豆品种的所述高通量测序文库分别进行高通量测序,分别得到两个所述待测大豆品种的测序片段组;分析两个所述待测大豆品种的测序片段组,分别获得两个待测大豆品种基因型,所述待测大豆品种基因型为所述测试区域内变异碱基的组合,且所述待测大豆品种基因型的频率≥30%;比较两个所述待测大豆品种基因型,获得待测大豆品种间差异基因型的比例;根据所述差异基因型的比例,判断两个所述待测大豆品种的实质性派生关系。 |
地址 |
100122 北京市朝阳区东三环南路96号农丰大厦 |