一组基于ARMs-PCR法检测CYP3A4、CYP3A5、MDR1基因多态性的引物及制备的试剂盒

摘要

本发明公开了一组基于ARMs-PCR法检测CYP3A4、CYP3A5、MDR1基因多态性的引物及制备的试剂盒，引物序列如SEQ1～SEQ18所示。通过引物组合，这些引物可以通过特异性扩增，快速准确的对人类CYP3A4、CYP3A5、MDR1基因的多态性进行分型检测。依据本发明可以进行基因分型或制备分型试剂盒，用于检测人群相关药物代谢能力(他克莫司，环孢素A等)，为专业医生确定最佳药物剂量和个体化用药提供参考依据，降低用药风险。

主权项

一组基于ARMs‑PCR法检测CYP3A4、CYP3A5、MDR1基因多态性的引物，其特征在于，针对CYP3A4 rs2242480 C/T、CYP3A5 rs776746 C/T和MDR1 rs1045642 C/T三个SNP位点进行基因分型，所述针对每个SNP的序列改变而设计的特异性引物和共用下游引物，特异性引物于3’末端第二位或三位引入错配碱基，以此扩大特异性引物3’末端碱基与DNA模版上SNP位点碱基互补和不互补情况下扩增效率间的差距，提高检测的特异性和准确性，其中：用于检测位点CYP3A4 rs2242480 C/T的共用下游引物为：SEQ1：5’‑CCCAGTGTACCTCTGAATTGC‑3’；用于检测位点CYP3A4 rs2242480 T的特异性引物为下列核苷酸序列之一：SEQ2：5’‑TCCTCCCTCCTTCTCCATGTCT‑3’；SEQ3：5’‑CCTCCCTCCTTCTCCATGCAT‑3’；SEQ4：5’‑TCCTCCCTCCTTCTCCATGGAT‑3’；用于检测位点CYP3A4 rs2242480 C的特异性引物为下列核苷酸序列之一：SEQ5：5’‑CCTCCCTCCTTCTCCATGTCC‑3’；SEQ6：5’‑CCTCCCTCCTTCTCCATGCAC‑3’；SEQ7：5’‑CCTCCCTCCTTCTCCATGGAC‑3’；用于检测位点CYP3A5 rs776746 C/T的共用下游引物为：SEQ8：5’‑AGGCAACATGACTTAGTAGACAGATG‑3’；用于检测位点CYP3A5 rs776746 T的特异性引物为下列核苷酸序列之一：SEQ9：5’‑TGGTCCAAACAGGGAAGAGACAT‑3’；SEQ10：5’‑TGGTCCAAACAGGGAAGAGAGAT‑3’；用于检测位点CYP3A5 rs776746 C的特异性引物为下列核苷酸序列之一：SEQ11：5’‑TGGTCCAAACAGGGAAGAGATCC‑3’；SEQ12：5’‑TGGTCCAAACAGGGAAGAGAGAC‑3’；SEQ13：5’‑GGTCCAAACAGGGAAGAGACAC‑3’；用于检测位点MDR1 rs1045642 C/T的共用下游引物为：SEQ14：5’‑CCAGTTCTCCTATCCCAGAAATGT‑3’；用于检测位点MDR1 rs1045642 T的特异性引物为下列核苷酸序列之一：SEQ15：5’‑GGTGGTGTCACAGGAAGAGGTT‑3’；SEQ16：5’‑GGTGGTGTCACAGGAAGAGTTT‑3’；用于检测位点MDR1 rs1045642 C的特异性引物为下列核苷酸序列之一：SEQ17：5’‑GGTGGTGTCACAGGAAGAGGTC‑3’；SEQ18：5’‑GGTGGTGTCACAGGAAGAGTTC‑3’。