| 发明名称 | 基于InDel标记的杂交稻品种交源优69的鉴定方法 | ||
| 摘要 | 本发明属生物鉴别技术领域，具体为一种基于InDel标记的杂交稻品种交源优69的鉴定方法。本发明利用粳稻品种日本晴与籼稻品种93-11的全基因组DNA序列的比对而获得插入/缺失差异片段所设计的14对特异DNA引物。对交源优69及其亲本交源5A和JP69进行DNA提取、DNA片段扩增和电泳分离以及电泳图谱的分析来鉴定交源优69。具体而言，利用14对InDel引物组合，对基于聚合酶链式反应和凝胶垂直板电泳获得的指纹图谱进行分析，根据14个InDel位点的电泳带型，进而确定是否是杂交稻品种交源优69。本发明需用检测样品量少，方法简便快捷，鉴定结果准确，可以应用到市场上的交源优69的品种鉴定中。 | ||
| 申请公布号 | CN104789671A | 申请公布日期 | 2015.07.22 |
| 申请号 | CN201510171095.8 | 申请日期 | 2015.04.10 |
| 申请人 | 上海交通大学 | 发明人 | 张大兵;吕阳;袁政;罗治靖;陈明姣 |
| 分类号 | C12Q1/68(2006.01)I;C12N15/11(2006.01)I | 主分类号 | C12Q1/68(2006.01)I |
| 代理机构 | 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 | 代理人 | 郭国中;陈少凌 |
| 主权项 | 一组基于InDel标记的杂交稻品种交源优69的鉴定用InDel特异引物对，其特征在于，所述特异引物对如下列表所述：<tables num="0001" id="ctbl0001"><table><tgroup cols="4"><colspec colname="c001" colwidth="7%" /><colspec colname="c002" colwidth="16%" /><colspec colname="c003" colwidth="38%" /><colspec colname="c004" colwidth="39%" /><tbody><row><entry morerows="1">编号</entry><entry morerows="1">引物对名称</entry><entry morerows="1">正向引物序列(5'‑>3')</entry><entry morerows="1">反向引物序列(5'‑>3')</entry></row><row><entry morerows="1">1_1</entry><entry morerows="1">ZFA69_chr1_1</entry><entry morerows="1">ATACTGCTCTAGAATCTGTTGATCG</entry><entry morerows="1">ACTAGCATTGAACTTACATGGTTTC</entry></row><row><entry morerows="1">1_2</entry><entry morerows="1">ZFA69_chr1_2</entry><entry morerows="1">GAATTAAAAACCATTCCGTGTTGAC</entry><entry morerows="1">GATTCTTCAATCTTTACCCATCTTC</entry></row><row><entry morerows="1">2_2</entry><entry morerows="1">ZFA69_chr2_2</entry><entry morerows="1">AGAATACAGAAAATGCATCACTCAC</entry><entry morerows="1">TGTGTTTGTTGACGTACTTTAGATG</entry></row><row><entry morerows="1">4_1</entry><entry morerows="1">ZFA69_chr4_1</entry><entry morerows="1">GTCTTCGTTTTGGTTATGGTATTTC</entry><entry morerows="1">CCTATTCAATGGACCTAGGATGTC</entry></row><row><entry morerows="1">4_2</entry><entry morerows="1">ZFA69_chr4_2</entry><entry morerows="1">TTAGTCCTTTACTTATGCGTAGTCG</entry><entry morerows="1">CTACCAGGTGATTATCCATCCATAG</entry></row><row><entry morerows="1">4_4</entry><entry morerows="1">ZFA69_chr4_4</entry><entry morerows="1">ACTACTATGGGCCTATTTGGTAGAG</entry><entry morerows="1">ACCTCAGCTCCACTTAAAATAGAAG</entry></row><row><entry morerows="1">5_1</entry><entry morerows="1">ZFA69_chr5_1</entry><entry morerows="1">GAAGACAACACAATTACAGAGAGAG</entry><entry morerows="1">GCTGAACTATTGCTGAAAATGTTAC</entry></row><row><entry morerows="1">7_2</entry><entry morerows="1">ZFA69_chr7_2</entry><entry morerows="1">CTGGTAAACACAAGTGATAATAACC</entry><entry morerows="1">GTAAGAATTGTTTCCTTGGATATGG</entry></row><row><entry morerows="1">9_1</entry><entry morerows="1">ZFA69_chr9_1</entry><entry morerows="1">ACATACTTACGTTAGCAGGAATGAG</entry><entry morerows="1">AAGTAGATATGGAGGATGTGTATGC</entry></row><row><entry morerows="1">9_2</entry><entry morerows="1">ZFA69_chr9_2</entry><entry morerows="1">ATATCTTTGGTCTCTACCAATACGC</entry><entry morerows="1">TTCAATTATATATGGACTGTGGTGG</entry></row><row><entry morerows="1">9_3</entry><entry morerows="1">ZFA69_chr9_3</entry><entry morerows="1">ACACTTGTGTCGCCTTATACTTTAC</entry><entry morerows="1">ATAGTTCATCTTGTTTCACGTGCC</entry></row><row><entry morerows="1">10_1</entry><entry morerows="1">ZFA69_chr10_1</entry><entry morerows="1">ATAGACGACACAAGAAGATAGAGAG</entry><entry morerows="1">ATAGAACACATTCTTAGGTCCGAG</entry></row><row><entry morerows="1">11_2</entry><entry morerows="1">ZFA69_chr11_2</entry><entry morerows="1">GTCATACCATTAGGCAAATCTACTC</entry><entry morerows="1">GGTATAACACCTCCTTTCTAAGGC</entry></row><row><entry morerows="1">11_3</entry><entry morerows="1">ZFA69_chr11_3</entry><entry morerows="1">GTCATGCATTCTGTAAGACCCTAAC</entry><entry morerows="1">AGTGGCATCTTATGTATTGTTTCAG</entry></row></tbody></tgroup></table></tables> | ||
| 地址 | 200240 上海市闵行区东川路800号 | ||