发明名称 实时荧光定量PCR方法鉴定转基因植物中T-DNA串联重复序列的拷贝数的方法
摘要 本发明公开了一种实时荧光定量PCR方法鉴定转基因植物中T-DNA串联重复序列的拷贝数的方法,步骤包括:通过农杆菌介导的植物转化方法将含有筛选基因BAR的植物表达载体pSKI015连接上HMGA基因,转入到野生型Col-4拟南芥中;使用两个参考质粒连接载体;将经过草甘膦筛选的转基因拟南芥的RNA进行提取,反转录获得cDNA作为检测的模板,分别使用草甘膦抗性基因和HMGA基因的定量引物进行实用定量PCR的方式检测突变体植物的拷贝数。本发明的有益效果在于可以有效屏蔽T-DNA串联结构对识别转基因植物拷贝数的影响,而且定量PCR与Southern blot相比更加方便高效。
申请公布号 CN104745696A 申请公布日期 2015.07.01
申请号 CN201510128008.0 申请日期 2015.03.23
申请人 安徽农业大学 发明人 魏书;席玉珍;刘晶晶;宋大鹏
分类号 C12Q1/68(2006.01)I;C12N15/84(2006.01)I;C12N15/65(2006.01)I;A01H5/00(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 安徽汇朴律师事务所 34116 代理人 胡敏
主权项 一种实时荧光定量PCR方法鉴定转基因植物中T‑DNA串联重复序列的拷贝数的方法,其特征在于,步骤包括:通过农杆菌介导的植物转化方法将含有筛选基因BAR的植物表达载体pSKI015连接上HMGA基因,转入到野生型Col‑4拟南芥中,获得了300个独立转基因株系;使用两个参考质粒如序列表,该两个参考质粒都含有一个编码拟南芥高迁移率蛋白HMGA的内参基因,其中一个质粒是将HMGA基因与PSKI015载体上的BAR基因连接,另一个质粒是将HMGA基因与含有左边界LB和右边界RB的T‑DNA正向重复序列连接,分别形成TOPO_HMGA_BAR和TOPO_HMGA_LR两个参考质粒;将经过草甘膦筛选的转基因拟南芥的RNA进行提取,反转录获得cDNA作为检测的模板,分别使用草甘膦抗性基因和HMGA基因的定量引物进行实用定量PCR的方式检测突变体植物的拷贝数;计算公式:<img file="FDA0000686307690000011.GIF" wi="1580" he="392" />t代表目标T‑DNA基因,r代表HMGA基因R<sub>t</sub>的公式:R<sub>t</sub>=(F<sub>at</sub>×F<sub>ct</sub>)/F<sub>bt</sub><sup>2</sup>F<sub>at</sub>,F<sub>ct</sub>,F<sub>bt</sub>分表代表植物目标基因的荧光强度。
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