| 发明名称 | 检测转基因外源片段插入位点的方法和系统 | ||
| 摘要 | 本发明公开一种检测转基因外源片段插入位点的方法和系统。该方法包括：通过比对确定外源单侧短片段和基因组单侧短片段，并根据外源单侧短片段和基因组单侧短片段的交集确定外源片段在基因组序列中的插入位点。 | ||
| 申请公布号 | CN103270175B | 申请公布日期 | 2015.06.24 |
| 申请号 | CN201180062256.X | 申请日期 | 2011.01.20 |
| 申请人 | 深圳华大基因科技有限公司 | 发明人 | 郭小森;陈帅;张雪梅;郎继东;李俊;胡雪松;陈聪群 |
| 分类号 | C12Q1/68(2006.01)I;G01N33/00(2006.01)I | 主分类号 | C12Q1/68(2006.01)I |
| 代理机构 | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人 | 李志东 |
| 主权项 | 一种转基因外源片段插入位点检测方法，其特征在于，包括：将成对短片段序列和外源插入片段序列进行比对确定外源单侧短片段，所述成对短片段序列通过对待测样品的测序片段进行双末端重测序获得；将所述成对短片段序列和参考基因组序列进行比对确定基因组单侧短片段；根据所述外源单侧短片段和基因组单侧短片段的交集确定外源片段在基因组序列中的插入位点，其中，所述外源单侧短片段包括只有一条短片段序列比对到所述外源插入片段序列上的成对短片段序列；所述基因组单侧短片段包括只有一条短片段序列比对到所述参考基因组序列上的成对短片段序列。 | ||
| 地址 | 518083 广东省深圳市盐田区北山路146号北山工业区综合楼11F-3 | ||