变异型DNA的检测方法

摘要

本发明涉及一种变异型DNA的检测方法，其是使用了探针的变异型DNA的检测方法，其特征在于：（1）使含有具有取代碱基、缺失碱基区域或插入碱基区域的单链DNA（变异型DNA）或/和其对应的野生型的单链DNA（野生型DNA）的试样和与两单链DNA杂交的探针接触，形成与变异型DNA的杂交体（变异型杂交体）或/和与野生型DNA的杂交体（野生型杂交体），得到的变异型杂交体及野生型杂交体中的至少一方具有茎结构；（2）利用茎结构的有无或茎结构的差异，通过电泳法将得到的变异型杂交体或/和野生型杂交体分离；（3）检测试样中有无变异型DNA。

主权项

一种变异型DNA检测用的探针，其是与变异型DNA及野生型DNA杂交，从而形成各自的杂交体的变异型DNA检测用的探针，其特征在于，所述探针是由以下的任一序列表示的、且由30～300个碱基的碱基序列构成的寡聚DNA，3’1stSS₁‑X’₁‑St_P1‑X’₂‑X’₃‑X’₄‑X’₅‑2ndSS₁5’或者3’1stSS₁‑X’₁‑X’₂‑X’₃‑X’₄‑St_P1‑X’₅‑2ndSS₁5’上述序列中，1stSS₁、2ndSS₁分别表示与野生型DNA及变异型DNA互补的单链的碱基序列，X’₁及X’₅表示任意的碱基，X’₂～X’₄表示任意的碱基或结合键，其中的任意一个是与变异碱基互补的碱基或与变异碱基所对应的正常碱基互补的碱基，该与变异碱基互补的碱基或与正常碱基互补的碱基在杂交时存在于变异型DNA的取代碱基及野生型DNA的正常碱基所对应的位置上，St_P1表示在探针侧形成茎结构的序列，所述变异型DNA、及与所述变异型DNA对应的野生型DNA是由50～2000个碱基的碱基序列构成的单链DNA，且所述变异型DNA具有取代碱基，通过杂交形成的变异型杂交体及野生型杂交体中的至少一方在探针侧具有至少2个碱基对以上的连续的茎结构，利用所述茎结构的有无或所述茎结构的差异，通过电泳法分离所述变异型杂交体和野生型杂交体，从而对试样中有无变异型DNA进行检测。