发明名称 RNA和DNA双外参以及DNA内参实时定量荧光PCR检测方法
摘要 本发明公开了一种RNA和DNA双外参以及DNA内参实时定量荧光PCR检测方法,包括步骤:选定外参基因和内参基因;制备外参基因mRNA与DNA的预混合液;收集样品及预混合液的总mRNA和DNA;实时定量荧光PCR,检测外参基因和待测基因的mRNA和DNA拷贝数以及内参基因DNA拷贝数,从而同时得到基因的表观表达水平、DNA拷贝数相对量以及细胞水平相对表达量,为基因样本检测及机理研究提供了多层次信息。
申请公布号 CN103589803B 申请公布日期 2015.06.10
申请号 CN201310595973.X 申请日期 2013.11.21
申请人 上海生物信息技术研究中心 发明人 李园园;陆长德;蒋昊韡
分类号 C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 上海麦其知识产权代理事务所(普通合伙) 31257 代理人 董红曼
主权项 一种非诊断目的的RNA和DNA双外参以及DNA内参实时定量荧光PCR检测方法,同时检测待测基因的表观表达水平、DNA拷贝数相对量以及细胞水平相对表达量,其包括如下步骤:1)选定外参基因,配制外参基因mRNA与DNA的预混合液;所述外参基因为待测样品中不存在的序列;2)选定内参基因;其中,所述内参基因为不易发生拷贝数变异的CNV冷区的DNA区域;3)将步骤1)制备的所述预混合液与待测样品混合,分别抽提总mRNA和总DNA;4)总mRNA进行逆转录合成第一条cDNA链后与总DNA分别进行实时定量荧光PCR扩增,检测待测基因的mRNA和DNA的扩增产物的拷贝数、外参基因的mRNA和DNA的扩增产物的拷贝数,以及内参基因DNA扩增产物的拷贝数,根据如下公式计算同时检测得到待测基因的表观表达水平、DNA拷贝数相对量以及细胞水平相对表达量:<img file="FDA0000658630660000011.GIF" wi="1410" he="310" /><img file="FDA0000658630660000012.GIF" wi="1121" he="159" />待测基因的细胞水平相对表达量=待测基因的表观表达水平×待测基因的DNA拷贝数相对量。
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