发明名称 |
RNA和DNA双外参以及DNA内参实时定量荧光PCR检测方法 |
摘要 |
本发明公开了一种RNA和DNA双外参以及DNA内参实时定量荧光PCR检测方法,包括步骤:选定外参基因和内参基因;制备外参基因mRNA与DNA的预混合液;收集样品及预混合液的总mRNA和DNA;实时定量荧光PCR,检测外参基因和待测基因的mRNA和DNA拷贝数以及内参基因DNA拷贝数,从而同时得到基因的表观表达水平、DNA拷贝数相对量以及细胞水平相对表达量,为基因样本检测及机理研究提供了多层次信息。 |
申请公布号 |
CN103589803B |
申请公布日期 |
2015.06.10 |
申请号 |
CN201310595973.X |
申请日期 |
2013.11.21 |
申请人 |
上海生物信息技术研究中心 |
发明人 |
李园园;陆长德;蒋昊韡 |
分类号 |
C12Q1/68(2006.01)I |
主分类号 |
C12Q1/68(2006.01)I |
代理机构 |
上海麦其知识产权代理事务所(普通合伙) 31257 |
代理人 |
董红曼 |
主权项 |
一种非诊断目的的RNA和DNA双外参以及DNA内参实时定量荧光PCR检测方法,同时检测待测基因的表观表达水平、DNA拷贝数相对量以及细胞水平相对表达量,其包括如下步骤:1)选定外参基因,配制外参基因mRNA与DNA的预混合液;所述外参基因为待测样品中不存在的序列;2)选定内参基因;其中,所述内参基因为不易发生拷贝数变异的CNV冷区的DNA区域;3)将步骤1)制备的所述预混合液与待测样品混合,分别抽提总mRNA和总DNA;4)总mRNA进行逆转录合成第一条cDNA链后与总DNA分别进行实时定量荧光PCR扩增,检测待测基因的mRNA和DNA的扩增产物的拷贝数、外参基因的mRNA和DNA的扩增产物的拷贝数,以及内参基因DNA扩增产物的拷贝数,根据如下公式计算同时检测得到待测基因的表观表达水平、DNA拷贝数相对量以及细胞水平相对表达量:<img file="FDA0000658630660000011.GIF" wi="1410" he="310" /><img file="FDA0000658630660000012.GIF" wi="1121" he="159" />待测基因的细胞水平相对表达量=待测基因的表观表达水平×待测基因的DNA拷贝数相对量。 |
地址 |
201203 上海市浦东新区科苑路1278号2楼 |