一种基因组代谢网络模型自动化修正方法

摘要

本发明公开了一种基因组代谢网络模型自动化修正方法，利用了超文本传送协议和Java控件HttpClient相结合、并利用图像处理算法，实现自动提交并分析网站脚本语义，基于KEGG、MetaCyc、MetRxn在线数据库以及多个蛋白区间定位预测网站对基因组规模代谢网络模型进行了自动化断点补齐，同时通过蛋白区间预测结果和权重打分机制确定可信度高的特异性反应，完成代谢网络粗模型的自动化修正过程。利用本发明所述的方法进行基因组代谢网络模型修正的优点是更加省时、方便，且所得修正模型更为全面、准确。

主权项

一种基因组代谢网络模型自动化修正方法，其特征是，包括以下步骤：(1)、根据基因组代谢网络模型中的漏洞代谢物列表，填补物种的特异性反应；(2)、根据物种的特异性反应中代谢物名称，确定模型中反应的方向；(3)、确定模型中最佳反应区间。