序列比较分析方法和系统

摘要

本发明提供通过比较样本核酸序列信息与参考核酸序列信息或从参考样本获得的信息来快速鉴别或确定样本核酸中的序列信息的方法。本发明还提供进行序列比较分析的自动化系统。

主权项

一种确定样本中是否存在靶核苷酸序列的方法，其包含：a.鉴别(i)一组源自使所述样本中的核酸与特异性裂解剂接触而产生的裂解产物的样本质量信号与(ii)一组源自接触或虚拟接触所述特异性裂解剂的参考核酸所产生的裂解产物的参考质量信号之间的匹配峰型，并进行评分；其中所述评分通过计算结合了位图得分、区别性特征匹配得分、和距离得分的总得分而得出；b.通过对样本信号组与参考信号组之间的最高等级匹配峰型亚组中的匹配峰型进行迭代重复评分从而鉴别一个或多个最高等级匹配峰型；并且c.由所述一个或多个最高等级匹配峰型之间的匹配，确定所述样本中是否存在所述靶核苷酸序列。