一种谷子育种材料细胞质类型的划分方法

摘要

本发明公开了一种谷子育种材料细胞质类型的划分方法，其特征在于包括以下步骤：(1)细胞质来源进化树的构建；(2)母本衍生进化图的构建；(3)特定遗传相似系数的确定及细胞质来源的分子聚类；(4)谷子育种材料细胞质类型的确定。本发明为培育不同细胞质类型的不育系和杂交种奠定了基础，为创制不同细胞质类型的谷子不育系，培育不同细胞质类型的谷子杂交种奠定基础。

主权项

一种谷子育种材料细胞质类型的划分方法，其特征在于包括如下步骤：（1）细胞质来源进化树的构建；（2）母本衍生进化图的构建；（3）特定遗传相似系数的确定及细胞质来源的分子聚类；（4）谷子育种材料细胞质类型的确定；其中，步骤（1）所述的细胞质来源进化树的构建包括如下步骤：①叶片组织的培养与获取：将谷子育种材料的种子种于育苗盘中获得谷子幼苗，于4叶期分别剪取育种材料的叶片组织；②全基因组DNA的提取：采用CTAB法提取步骤①中叶片组织的全基因组DNA；③PCR扩增：采用20μl反应体系，利用线粒体特异引物对步骤②提取的基因组DNA进行37个反应循环PCR扩增；④多态性检测：利用凝胶电泳法对步骤③中线粒体的PCR扩增产物进行多态性检测；⑤细胞质来源进化树的生成：对步骤④中电泳图谱上清晰且可重复出现的条带记为“1”，同一位置没有出现的带记为“0”，生成由“1”和“0”组成的原始矩阵，用NTSYS‑pc2.1软件进行数据分析，用SAHN程序中的UPGMA方法进行聚类分析，生成细胞质来源的进化树；其中，步骤（2）所述的母本衍生进化图的构建为：利用系谱追踪法将谷子育种材料按步骤（1）中所述的细胞质来源进化树的构建中所构建进化树的排列顺序进行纵向排列，通过逐代向上追踪育种材料的母本，直到追踪到农家品种为止，依据系谱将同一母本衍生的育种材料按照衍生关系逐步连接起来，形成母本衍生进化图；其中，步骤（3）的具体操作方法为：将步骤⑵谷子育种材料的母本衍生进化图与步骤⑴的细胞质来源进化树相结合，并进行比较分析，确定基本能将同一母本衍生系统聚为一个分枝的特定遗传相似系数，在该遗传相似系数下对步骤⑴的细胞质来源进化树进行纵切，将谷子育种材料进行胞质来源的分子聚类，分子聚类中每个分枝代表一个胞质类群。