苯并吡喃鎓化合物

摘要

用作标记的具有与已知荧光化合物相当特性的化合物。所述化合物与蛋白质和核酸缀合用于生物成像和分析。提供了所述化合物的合成，所述缀合化合物的形成和用途以及它们各自的具体的非限制性实例。

主权项

下述任一通式的化合物:通式Ia通式Ib通式Ic通式Id通式Ie通式If通式Ig通式Ih通式IIa通式IIb通式IIc通式IId通式IIe通式IIf通式IIg通式IIh其中R¹，R²，R³，R⁴，R⁵，R⁶，R¹¹和R¹²各自相同或不同且独立地选自H，SO₃，Z，L‑Z，PEG基团P‑L‑Z，其中P是乙二醇基团，二甘醇基团或聚乙二醇基团，其中该聚乙二醇基团是(CH₂CH₂O)_s，其中s是3‑6的整数，该整数包括端值，磺酰胺基团‑L‑SO₂NH‑P‑L‑Z，甲酰胺基团‑L‑CONH‑P‑L‑Z，氢，烷基‑，叔‑烷基，芳基‑，羧基芳基‑，二羧基芳基，杂芳基‑，环烷基‑，杂环烷基‑，烷氧基‑，烷基巯基‑，其中烷基和环烷基包括烯烃键残基，芳基氧基‑，芳基巯基‑，杂芳基氧基‑，杂芳基巯基‑，羟基‑，硝基‑，羧酸，氨基或氰基残基；其中L是二价直链(‑(CH₂)_t‑，t＝0‑15)，支链或环状烷基基团，其可以被氧，氮，取代的氮和/或硫中的至少一个原子取代；其中Z是H，CH₃，烷基，磺基烷基，杂烷基，NH₂，‑COO^‑，‑COOH，‑COSH，CO‑NH‑NH₂，‑COF，‑COCl，‑COBr，‑COI，‑COO‑Su(琥珀酰亚胺基/磺基琥珀酰亚胺基)，‑COO‑STP(4‑磺基‑2,3,5,6‑四氟苯基)，‑COO‑TFP(2,3,5,6‑四氟苯基)，‑COO‑苯并三唑，‑CO‑苯并三唑，‑CONR'‑CO‑CH₂‑I，‑CONR'R″，‑CONR'‑生物分子，‑CONR'‑L‑COO^‑，‑CONR'‑L‑COOH，‑CONR'‑L‑COO‑Su，‑CONR'‑L‑COO‑STP，‑CONR'‑L‑COO‑TFP，‑CONR'‑L‑CONR″₂，‑CONR'‑L‑CO‑生物分子，‑CONR'‑L‑CO‑NH‑NH₂，‑CONR'‑L‑OH，‑CONR'‑L‑O‑亚磷酰胺，‑CONR'‑L‑CHO，‑CONR'‑L‑马来酰亚胺或‑CONR'‑L‑NH‑CO‑CH₂‑I；R'和R″各自选自H，脂族基团或杂脂族基团且所述生物分子是蛋白质，肽，抗体，核苷酸，寡核苷酸，生物素或半抗原；R¹⁰，R¹³和R¹⁴各自相同或不同且独立地选自脂族基团，杂脂族基团，磺基烷基，羧基烷基，带有末端的SO₃的杂脂族基团，Z，L‑Z，PEG基团P‑L‑Z，其中P是乙二醇基团，二甘醇基团或聚乙二醇基团，其中该聚乙二醇基团是(CH₂CH₂O)_s，其中s是3‑6的整数，该整数包括端值，磺酰胺基团‑L‑SO₂NH‑P‑L‑Z或甲酰胺基团‑L‑CONH‑P‑L‑Z；R⁷和R⁹各自相同或不同且独立地是氢，脂族基团，杂脂族基团或PEG基团P‑L‑Z，其中P选自乙二醇基团，二甘醇基团或聚乙二醇基团，其中该聚乙二醇基团是(CH₂CH₂O)_s，其中s是3‑6的整数，该整数包括端值；或R7和R9一起形成环状结构，其中R3和R4使用选自如下的二价结构单元结合：‑(CH₂)_q‑，‑(CH₂)_qO(CH₂)_q'‑，‑(CH₂)_qS(CH₂)_q'‑，‑(CH₂)_qCH＝CH‑，‑OCH＝CH‑，其中q和q'各自相同或不同且是1‑6的整数，该整数包括端值；且R⁸选自氢，烷基，磺基烷基，氟，氯，溴和PEG基团P‑L‑Z，其中P选自乙二醇基团，二甘醇基团或聚乙二醇基团，其中该聚乙二醇基团是(CH₂CH₂O)_s，其中s是3‑6的整数，该整数包括端值；R¹和R²，R²和R³，R³和R⁴，R⁵和R⁶，R⁵和R⁸，R⁹和R¹⁰，R¹¹和R¹²或R¹²和R¹³各自可以形成一个或多个脂族，杂脂族或芳族环，且其中得到的环任选地被至少一个下列基团取代：烷基‑，磺基烷基，叔‑烷基，芳基‑，羧基芳基‑，二羧基芳基，杂芳基‑，环烷基‑，杂环烷基‑，烷氧基‑，烷基巯基‑，其中烷基和环烷基包括烯烃键残基，芳基氧基‑，芳基巯基‑，杂芳基氧基‑，杂芳基巯基‑，羟基‑，硝基‑，磺酸，羧酸，氨基或氰基残基；R¹‑R¹⁴中的至少一个除了包含至少一个PEG之外，还任选地包含另外的增溶，电离或离子化取代基，其选自SO₃^‑，PO₃^2‑，CO₂H，OH，NR₃⁺，提供亲水性特征的环糊精或糖；所述取代基任选地通过脂族基团或杂脂族基团或环状间隔基连接至发色团；Kat是Na⁺，K⁺，Ca²⁺，氨或其它补偿负电荷所需的阳离子的成员；n是0，1，2或3；o是0‑12的整数，该整数包括端值；且p是1‑6的整数，该整数包括端值。