基于细胞的探询式分析及其应用

摘要

本文描述的是一个用于通过建模来分析生物系统或过程(例如，疾病状态，如癌症)的发现平台技术。

主权项

一种用于鉴别生物系统的调节子的方法，所述方法包括：使用与该生物系统相关的细胞建立该生物系统的模型来代表该生物系统的特征性方面；从所述模型获得第一数据集，其中所述第一数据集代表与该生物系统相关的细胞中的总体蛋白质组学改变；从所述模型获得第二数据集，其中所述第二数据集代表与该生物系统相关的细胞的一种或多种功能活性或细胞反应，其中所述细胞的一种或多种功能活性或细胞反应包括与该生物系统相关的细胞中的总体酶学活性和/或总体酶学活性对酶代谢产物或底物的效应；用编程的计算设备，仅仅基于所述第一数据集和第二数据集，生成所述总体蛋白质组学改变和所述一种或多种功能活性或细胞反应之间的一致因果关系网络，其中所述一致因果关系网络的生成不基于所述第一数据集和第二数据集以外的任何已知的生物学关系；从该一致因果关系网络鉴别在该生物系统中独特的因果关系，其中与该独特的因果关系相关的至少一种酶被确定为该生物系统的调节子。