Método de tipado de ácido nucleico para seleccionar donantes registrados para determinar la compatibilidad cruzada con receptores de transfusión

摘要

Método de selección de un donante de transfusión mediante la determinación de la compatibilidad con un receptor comparando combinaciones de marcadores polimórficos en un conjunto de tales marcadores, de donantes candidatos y un receptor en el que dicha determinación se realiza tras someter material genómico/ADN de donantes candidatos y el receptor a amplificación para generar de ese modo productos amplificados, en el que los productos amplificados se someten a un ensayo de hibridación o a un ensayo de elongación mediado por captura o a ambos, en el que se genera una señal de ensayo por los eventos de hibridación o elongación individuales, según sea aplicable, mediante pares de sondas en las que los miembros del par son complementarios, en su totalidad o en parte, a las subsecuencias de los productos amplificados que son los mismos que y/o que son complementarios a los marcadores polimórficos en el conjunto; en el que se genera un patrón de intensidad de señal de ensayo a partir de eventos de hibridación o elongación, de modo que cada marcador en el conjunto está representado por un par de intensidades de señal de ensayo particulares, comprendiendo el método: determinar el patrón de intensidad de señal de ensayo generado a partir de dicho ensayo de hibridación o elongación y formar, para cada par de sondas, una combinación de intensidades de señal asociadas con los miembros del par; generar a partir de dichas combinaciones de intensidades de señal una serie de valores, cada valor en la serie seleccionado de uno de tres posibles valores, que indican respectivamente un estado homocigótico normal, heterocigótico u homocigótico variante para formar de ese modo un patrón de reacción; determinar las combinaciones de marcadores polimórficos representadas por dichos patrones de reacción; y seleccionar de los donantes candidatos un donante que tiene dicha combinación de marcadores polimórficos idéntica a la del receptor, en el que la combinación de intensidades de señal de miembros se representa de modo que una intensidad de este tipo, iN, se correlaciona con la cantidad de marcador normal en la muestra, y la otra intensidad de este tipo, iV, se correlaciona con la cantidad de marcador variante en la muestra, y dichas intensidades se combinan para formar un parámetro de discriminaciónΔ>= (iN-iV)/(iN+iV) que varía entre -1 y 1.