一种鉴定两系杂交水稻种子纯度的方法

摘要

本发明公开了一种鉴定两系杂交水稻种子纯度的方法，包括：提取待检测种子或其长成的植株样品的基因组DNA；根据雄性核不育基因的功能性单核苷酸多态性位点，设计引物，进行PCR扩增；对PCR扩增产物进行特性分析，确定样品的基因型，计算得到种子样品的纯度。本发明根据功能基因的功能性单核苷酸多态性位点开发分子标记，任何杂交组合的双亲之间必然存在多态性，在进行杂交种子纯度鉴定时不需要先对双亲进行研究，因此可以直接对所有以本发明涉及的两系不育系为母本的两系杂交组合进行分析。另外，本发明方法通过常规的室内试验，经济，简便，快速，准确鉴定水稻杂交种子纯度。

主权项

一种鉴定两系杂交水稻种子纯度的方法，包括：(1)提取待检测种子或其长成的植株样品的基因组DNA；(2)根据雄性核不育基因的功能性单核苷酸多态性位点，设计引物，进行PCR扩增；(3)对PCR扩增产物进行特性分析，确定样品的基因型，计算得到种子样品的纯度；待检测种子为两系不育系与可育材料配制杂交组合产生的杂种一代种子，其中两系不育系携带广占63S相同的温敏不育基因；所述特性分析为高分辨率溶解曲线分析或扩增产物酶切片段多态性分析；对温敏组合杂种进行扩增产物酶切片段多态性分析时，步骤(2)中，所述引物为两对，其中，第一对引物的碱基序列为：上游引物RNZ‑F1：5’‑ACCGCGCCGCCACCGGGTCGGCCGGAG‑3’；下游引物RNZ‑R1：5’‑TGAAGAGGAACTCCTGCGAGACGG‑3’；第二对引物的碱基序列为：上游引物RNZ‑F2：5’‑ACCGCGCCGCCACCGGGTCGGCCCAAG‑3’；下游引物RNZ‑R1：5’‑TGAAGAGGAACTCCTGCGAGACGG‑3’；对温敏组合杂种进行高分辨率溶解曲线分析时，步骤(2)中，所述引物的碱基序列为：上游引物RNZ‑F3：5’‑ATGGCGAACAGCGGCAAGTCA‑3’；下游引物RNZ‑R1：5’‑TGAAGAGGAACTCCTGCGAGACGG‑3’。