用于提高多肽产率的方法

摘要

本发明涉及用于提高蛋白质产率的方法。所述方法包括修饰一组相关蛋白质特征的数值，使其落入对真核宿主中一种或多种蛋白质特征而言的最适范围内，或者变得更接近对真核宿主中一种或多种蛋白质特征而言的最适值。

主权项

用于提高真核宿主细胞对感兴趣的多肽的分泌的方法，所述方法包括修饰所述多肽的氨基酸主链中一组相关的蛋白质特征的数值，使其落入对所述真核宿主中一种或多种蛋白质特征而言的最适范围内，或者更接近对所述真核宿主中一种或多种蛋白质特征而言的最适值，其中蛋白质特征是能够通过计算源自蛋白质氨基酸序列和DNA序列的特性，所述方法包括：(i)测定对所述真核宿主中一种或多种蛋白质特征而言的最适范围和最适值，和(ii)测定所述真核宿主中一组相关蛋白质特征，当所述多肽的氨基酸主链中这些相关特征中的一种或多种被修饰时，所述特征会提高所述真核宿主分泌所述多肽，和(iii)修饰所述相关蛋白质特征的数值，使其落入(i)中测定的所述最适范围内，或者更接近(i)中测定的最适值，其中(i)和(ii)是按照任何顺序进行的，其中，这样来测定一组相关特征：a.收集或创建数据组S，所述数据组S含有某真核宿主中合适量蛋白质的分泌水平，以及这些蛋白质的氨基酸序列和DNA序列b.针对数据组S中的所有蛋白质计算蛋白质特征F；c.使用统计学分类方法选择下述蛋白质特征亚组Fs，根据适当定义的分类器性能标准，所述蛋白质特征亚组给出了在分泌型蛋白质S+和非分泌型蛋白质S‑之间区分的统计学分类器的最佳性能，其中这样来测定对真核宿主而言多种蛋白质特征的最适范围或最适值：A.收集或创建数据组S，所述数据组S含有某真核宿主中合适量蛋白质的分泌水平，以及这些蛋白质的氨基酸序列和DNA序列B.针对数据组S中的所有蛋白质计算蛋白质特征F；C.如下测定针对真核宿主的每种特征的最适值F_pot：拟合由分泌型蛋白质S+计算的每种蛋白质特征的概率分布，使得所述特征数值的分布由所选择的概率分布良好地描述，D.测定针对所述真核宿主的每种特征的最适范围。