目标区域捕获方法及其生物信息处理方法和系统

摘要

本发明公开一种目标区域捕获方法及其生物信息处理方法和系统。所述目标区域捕获方法包括利用目标区域捕获芯片捕获目标区域捕获芯片指定使用物种的近源物种的基因片段；并对所述近源物种的基因片段进行测序获得基因片段序列。本发明的方法和系统，将为单一物种设计的基因芯片用于其它近源物种的目标区域捕获，从而帮助筛选近源物种的全基因组数据。

主权项

一种目标区域捕获方法，其特征在于，包括：利用目标区域捕获芯片捕获所述目标区域捕获芯片指定使用物种的近源物种的基因片段；对所述近源物种的基因片段进行测序获得基因片段序列；获取所述目标区域捕获芯片指定使用物种参考基因组上的捕获区域序列；根据所述捕获区域序列获取所述近源物种参考基因组上的近源区域，其中，所述获取目标区域捕获芯片指定使用物种参考基因组上的捕获区域序列包括：根据所述目标区域捕获芯片的捕获区域文件在所述目标区域捕获芯片指定使用物种的参考基因组上获取所述捕获区域序列，所述根据所述捕获区域序列获取所述近源物种参考基因组上的近源区域包括:将所述捕获区域序列与所述近源物种的参考基因组进行同源比对，获得所述近源物种参考基因组上的近源区域，所述目标区域捕获芯片为Agilent 2100Bioanalyzer。