发明名称 二次DNA片段化的基因组单倍型高通量测序方法
摘要 本发明公开了一种二次DNA片段化的基因组单倍型高通量测序方法,分两次对基因组DNA进行片段化后测序以获得单倍型信息:第一次DNA片段化将基因组DNA分割成为一系列较长的核酸片段,在较长的核酸片段中构建一组片段文库,对每个片段文库进行扩增;将扩增后的较长的核酸片段进行第二次DNA片段化,第二次DNA片段化后得到较短的核酸片段,每个片段文库独立构建测序文库并分别进行高通量测序,测序的结果首先在每个片段文库内部进行序列比对或拼接,获得较长的核酸序列后进行跨片段文库的序列比对和拼接,从而实现利用高通量测序获得基因组单倍型信息。本发明方法实现了利用高通量测序获得基因组单倍型信息,且简单、效率高。
申请公布号 CN104357563A 申请公布日期 2015.02.18
申请号 CN201410606732.5 申请日期 2014.10.30
申请人 东南大学 发明人 涂景;陆祖宏;高珅;郭靖;段梦沁;乔祎
分类号 C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 代理人 柏尚春
主权项 二次DNA片段化的基因组单倍型高通量测序方法,其特征在于:分两次对基因组DNA进行片段化后测序以获得单倍型信息:第一次DNA片段化将基因组DNA分割成为一系列较长的核酸片段,在较长的核酸片段中构建一组片段文库,对每个片段文库进行扩增;将扩增后的较长的核酸片段进行第二次DNA片段化,第二次DNA片段化后得到较短的核酸片段,每个片段文库独立构建测序文库并分别进行高通量测序,测序的结果首先在每个片段文库内部进行序列比对或拼接,获得较长的核酸序列后进行跨片段文库的序列比对和拼接,从而实现利用高通量测序获得基因组单倍型信息。
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