发明名称 | 二次DNA片段化的基因组单倍型高通量测序方法 | ||
摘要 | 本发明公开了一种二次DNA片段化的基因组单倍型高通量测序方法,分两次对基因组DNA进行片段化后测序以获得单倍型信息:第一次DNA片段化将基因组DNA分割成为一系列较长的核酸片段,在较长的核酸片段中构建一组片段文库,对每个片段文库进行扩增;将扩增后的较长的核酸片段进行第二次DNA片段化,第二次DNA片段化后得到较短的核酸片段,每个片段文库独立构建测序文库并分别进行高通量测序,测序的结果首先在每个片段文库内部进行序列比对或拼接,获得较长的核酸序列后进行跨片段文库的序列比对和拼接,从而实现利用高通量测序获得基因组单倍型信息。本发明方法实现了利用高通量测序获得基因组单倍型信息,且简单、效率高。 | ||
申请公布号 | CN104357563A | 申请公布日期 | 2015.02.18 |
申请号 | CN201410606732.5 | 申请日期 | 2014.10.30 |
申请人 | 东南大学 | 发明人 | 涂景;陆祖宏;高珅;郭靖;段梦沁;乔祎 |
分类号 | C12Q1/68(2006.01)I | 主分类号 | C12Q1/68(2006.01)I |
代理机构 | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 | 代理人 | 柏尚春 |
主权项 | 二次DNA片段化的基因组单倍型高通量测序方法,其特征在于:分两次对基因组DNA进行片段化后测序以获得单倍型信息:第一次DNA片段化将基因组DNA分割成为一系列较长的核酸片段,在较长的核酸片段中构建一组片段文库,对每个片段文库进行扩增;将扩增后的较长的核酸片段进行第二次DNA片段化,第二次DNA片段化后得到较短的核酸片段,每个片段文库独立构建测序文库并分别进行高通量测序,测序的结果首先在每个片段文库内部进行序列比对或拼接,获得较长的核酸序列后进行跨片段文库的序列比对和拼接,从而实现利用高通量测序获得基因组单倍型信息。 | ||
地址 | 214000 江苏省无锡市新区菱湖大道99号 |