相互作用预测装置、相互作用预测方法和程序

摘要

本发明取得化合物结构信息，取得与化合物相互作用的候选蛋白质的候选蛋白质结构信息，使用对接模拟方法来计算候选蛋白质与化合物的结合强度，进行结合强度的综合评价，由此确定出作为预测的结合强度的预测结合强度，确定出作为被预测为与化合物相互作用的候选蛋白质的预测蛋白质，使用结合强度模拟方法来计算相互作用强度，进行相互作用强度的综合评价，由此，确定出作为预测的相互作用强度的预测相互作用强度。

主权项

一种相互作用预测装置，其至少具有存储部和控制部，其特征在于，所述存储部具有：化合物结构信息存储单元，其存储与化合物的结构相关的化合物结构信息；以及蛋白质结构信息存储单元，其存储与蛋白质的结构相关的蛋白质结构信息，所述控制部具有：化合物结构信息取得单元，其从所述化合物结构信息存储单元取得所述化合物的所述化合物结构信息，或者，使用结构预测方法进行预测来取得所述化合物结构信息存储单元中未存储的所述化合物结构信息；蛋白质结构信息取得单元，其从所述蛋白质结构信息存储单元取得作为候选蛋白质的所述蛋白质结构信息的候选蛋白质结构信息，或者，使用所述结构预测方法进行预测来取得所述蛋白质结构信息存储单元中未存储的所述候选蛋白质结构信息，其中，所述候选蛋白质是作为与所述化合物相互作用的候选的所述蛋白质；预测蛋白质确定单元，其根据由所述化合物结构信息取得单元取得的所述化合物结构信息和由所述蛋白质结构信息取得单元取得的所述候选蛋白质结构信息，使用对接模拟方法来计算所述候选蛋白质与所述化合物的结合强度，使用学习方法和/或荟萃估计方法来进行该结合强度的综合评价，由此，确定出作为最终被预测出的所述结合强度的预测结合强度，确定出作为被预测为与所述化合物相互作用的所述候选蛋白质的预测蛋白质；以及相互作用强度确定单元，其根据由所述化合物结构信息取得单元取得的所述化合物结构信息和由所述预测蛋白质确定单元确定出的所述预测蛋白质的所述蛋白质结构信息，使用结合强度模拟方法来计算相互作用强度，使用所述学习方法和/或所述荟萃估计方法来进行该相互作用强度的所述综合评价，由此，确定出作为最终被预测出的所述相互作用强度的预测相互作用强度。