一种鉴定子鼠基因型的PCR方法

摘要

本发明涉及一种鉴定子鼠基因型的PCR方法，包括：（1）通过Blast两种品系小鼠的线粒体序列，找到4个SNP位点，选取其中一个位点以子代小鼠线粒体DNA为模板进行PCR扩增；（2）PCR结束后对PCR产物凝胶电泳检测，若出现阳性条带，则进行LDR反应；其中，LDR反应中，每一个SNP位点设计三条探针；（3）LDR结束后，对LDR产物进行凝胶电泳检测，电泳结束后，利用软件提取泳道数据，即可。本发明通过鉴定子代小鼠母本，比较子代表型差异，将母体效应和基因类型联系起来，补充了以往研究中通过改变孕鼠的营养状况或药物激素暴露等方式，从环境因素揭示母体效应的不足，扩展了人们对母体效应的遗传学机制的认识。

主权项

一种鉴定子鼠基因型的PCR方法，包括：(1)通过Blast两种品系小鼠的线粒体序列，找到4个SNP位点，选取其中一个位点以子代小鼠线粒体DNA为模板进行PCR扩增；其中，两种品系小鼠分别为B6C3HF1和C3HB6F1；作为模板的SNP位点为G9349A；PCR引物为：上游引物：5’‑CATTCTTCATGGCTACTGGATTC‑3’；下游引物：5’‑TGCTCATGGTAGTGGAAGTAGAA‑3’；(2)PCR结束后对PCR产物凝胶电泳检测，若出现阳性条带，则进行LDR反应；其中，LDR反应中，每一个SNP位点设计三条探针，一条为位点通用探针，另外两条位点特异性探针分别为：mtDNA_G：TTGGAGACGTATAGGAAAAGTCAGAC；mtDNA_A：TTTTGGAGACGTATAGGAAAAGTCAGAT；(3)LDR结束后，对LDR产物进行凝胶电泳检测，电泳结束后，利用软件提取泳道数据，即可。