一种应用145个SNP鉴定五指山小型猪近交系的方法

摘要

本发明公开了一种应用145个SNP鉴定五指山小型猪近交系的方法。本发明提供的辅助鉴定待测猪是否为五指山小型猪近交系的方法，包括如下步骤：检测待测猪基于145个SNP位点的基因型；如果满足(1)至(145)的所有标准，待测猪为候选的五指山小型猪近交系；如果不满足上述(1)至(145)的所有标准，待测猪为候选的非五指山小型猪近交系。本发明对于五指山小型猪近交系的种质资源鉴定具有重大价值。

主权项

一种辅助鉴定待测猪是否为五指山小型猪近交系的方法，包括如下步骤：检测待测猪基于145个SNP位点的基因型；如果满足如下(1)至(145)的所有标准，待测猪为候选的五指山小型猪近交系：(1)M1GA0025062  SNP位点的基因型为GG；(2)DRGA0017627  SNP位点的基因型为GG；(3)H3GA0056137  SNP位点的基因型为CC；(4)MARC0039661  SNP位点的基因型为AA；(5)ASGA0085025  SNP位点的基因型为TT；(6)ASGA0098570  SNP位点的基因型为GG；(7)MARC0063358  SNP位点的基因型为AA；(8)ASGA0085437  SNP位点的基因型为GG；(9)MARC0096709  SNP位点的基因型为CC；(10)H3GA0052387 SNP位点的基因型为GG；(11)ASGA0000264 SNP位点的基因型为TT；(12)ALGA0000195 SNP位点的基因型为TT；(13)H3GA0001444 SNP位点的基因型为AA；(14)ASGA0002293 SNP位点的基因型为CC；(15)INRA0001752 SNP位点的基因型为GG；(16)H3GA0001445 SNP位点的基因型为GG；(17)ALGA0002595 SNP位点的基因型为TT；(18)ALGA0002600 SNP位点的基因型为GG；(19)DRGA0000563 SNP位点的基因型为CC；(20)DRGA0000565 SNP位点的基因型为CC；(21)INRA0001761 SNP位点的基因型为AA；(22)MARC0104045 SNP位点的基因型为CC；(23)ALGA0002601 SNP位点的基因型为CC；(24)DRGA0000569 SNP位点的基因型为AA；(25)ALGA0002608 SNP位点的基因型为TT；(26)DRGA0000568 SNP位点的基因型为CC；(27)ALGA0002604 SNP位点的基因型为GG；(28)MARC0048118 SNP位点的基因型为TT；(29)ASGA0004229 SNP位点的基因型为CC；(30)MARC0007088 SNP位点的基因型为CC；(31)MARC0000061 SNP位点的基因型为GG；(32)MARC0094747 SNP位点的基因型为AA；(33)MARC0007969 SNP位点的基因型为AA；(34)ASGA0106092 SNP位点的基因型为CC；(35)ALGA0119806 SNP位点的基因型为GG；(36)INRA0003745 SNP位点的基因型为AA；(37)INRA0003746 SNP位点的基因型为TT；(38)ALGA0005490 SNP位点的基因型为CC；(39)H3GA0002538 SNP位点的基因型为CC；(40)INRA0003749 SNP位点的基因型为CC；(41)H3GA0002539 SNP位点的基因型为GG；(42)M1GA0001099 SNP位点的基因型为CC；(43)MARC0111831 SNP位点的基因型为AA；(44)ASGA0005566 SNP位点的基因型为CC；(45)ALGA0007578 SNP位点的基因型为CC；(46)ASGA0005568 SNP位点的基因型为CC；(47)INRA0005765 SNP位点的基因型为AA；(48)MARC0095347 SNP位点的基因型为CC；(49)MARC0039015 SNP位点的基因型为CC；(50)DRGA0001892 SNP位点的基因型为GG；(51)ALGA0007580 SNP位点的基因型为GG；(52)ALGA0007583 SNP位点的基因型为TT；(53)MARC0095915 SNP位点的基因型为CC；(54)ASGA0005571 SNP位点的基因型为AA；(55)MARC0014134 SNP位点的基因型为AA；(56)MARC0024233 SNP位点的基因型为AA；(57)H3GA0003548 SNP位点的基因型为GG；(58)ALGA0007591 SNP位点的基因型为CC；(59)MARC0000195 SNP位点的基因型为CC；(60)ALGA0038697 SNP位点的基因型为CC；(61)H3GA0020000 SNP位点的基因型为CC；(62)ALGA0038703 SNP位点的基因型为CC；(63)H3GA0020002 SNP位点的基因型为GG；(64)DRGA0007138 SNP位点的基因型为CC；(65)ASGA0031284 SNP位点的基因型为CC；(66)ASGA0031285 SNP位点的基因型为AA；(67)MARC0025042 SNP位点的基因型为GG；(68)H3GA0020006 SNP位点的基因型为TT；(69)ALGA0038729 SNP位点的基因型为CC；(70)ALGA0038731 SNP位点的基因型为GG；(71)ASGA0031321 SNP位点的基因型为GG；(72)ASGA0031322 SNP位点的基因型为GG；(73)ALGA0038747 SNP位点的基因型为AA；(74)ASGA0033095 SNP位点的基因型为TT；(75)ALGA0040854 SNP位点的基因型为GG；(76)ALGA0040856 SNP位点的基因型为AA；(77)ALGA0040857 SNP位点的基因型为GG；(78)ASGA0033096 SNP位点的基因型为GG；(79)INRA0025180 SNP位点的基因型为AA；(80)ALGA0040859 SNP位点的基因型为CC；(81)H3GA0021216 SNP位点的基因型为CC；(82)ASGA0033098 SNP位点的基因型为CC；(83)H3GA0021221 SNP位点的基因型为CC；(84)MARC0014540 SNP位点的基因型为CC；(85)ASGA0033103 SNP位点的基因型为CC；(86)DIAS0000557 SNP位点的基因型为AA；(87)ASGA0033116 SNP位点的基因型为AA；(88)ASGA0036835 SNP位点的基因型为CC；(89)MARC0031932 SNP位点的基因型为CC；(90)ASGA0036838 SNP位点的基因型为CC；(91)H3GA0023523 SNP位点的基因型为GG；(92)ALGA0045460 SNP位点的基因型为TT；(93)MARC0005927 SNP位点的基因型为GG；(94)MARC0005928 SNP位点的基因型为AA；(95)ASGA0036842 SNP位点的基因型为CC；(96)ASGA0036846 SNP位点的基因型为CC；(97)MARC0098637 SNP位点的基因型为TT；(98)M1GA0011035  SNP位点的基因型为TT；(99)DRGA0008230  SNP位点的基因型为GG；(100)ASGA0036855 SNP位点的基因型为CC；(101)ALGA0097277 SNP位点的基因型为GG；(102)MARC0080197 SNP位点的基因型为CC；(103)H3GA0050489 SNP位点的基因型为TT；(104)ALGA0097281 SNP位点的基因型为TT；(105)H3GA0050490 SNP位点的基因型为CC；(106)ALGA0097282 SNP位点的基因型为TT；(107)ASGA0079089 SNP位点的基因型为CC；(108)INRA0055354 SNP位点的基因型为GG；(109)ASGA0079091 SNP位点的基因型为TT；(110)ASGA0079090 SNP位点的基因型为CC；(111)H3GA0050491 SNP位点的基因型为AA；(112)MARC0056017 SNP位点的基因型为TT；(113)MARC0055759 SNP位点的基因型为AA；(114)H3GA0050495 SNP位点的基因型为GG；(115)ALGA0097291 SNP位点的基因型为GG；(116)ALGA0097290 SNP位点的基因型为GG；(117)CASI0006683 SNP位点的基因型为GG；(118)ASGA0079098 SNP位点的基因型为CC；(119)ALGA0097297 SNP位点的基因型为GG；(120)H3GA0054426 SNP位点的基因型为TT；(121)ALGA0098112 SNP位点的基因型为GG；(122)MARC0089391 SNP位点的基因型为GG；(123)ASGA0089892 SNP位点的基因型为AA；(124)ASGA0097792 SNP位点的基因型为CC；(125)MARC0046857 SNP位点的基因型为GG；(126)MARC0077194 SNP位点的基因型为AA；(127)ALGA0108769 SNP位点的基因型为CC；(128)H3GA0050799 SNP位点的基因型为CC；(129)ALGA0098120 SNP位点的基因型为CC；(130)ALGA0098123 SNP位点的基因型为GG；(131)ALGA0098128 SNP位点的基因型为GG；(132)ASGA0079719 SNP位点的基因型为CC；(133)ASGA0079728 SNP位点的基因型为GG；(134)ASGA0080429 SNP位点的基因型为CC；(135)MARC0052755 SNP位点的基因型为GG；(136)ALGA0098918 SNP位点的基因型为GG；(137)ASGA0080432 SNP位点的基因型为GG；(138)ALGA0098922 SNP位点的基因型为CC；(139)INRA0056206 SNP位点的基因型为GG；(140)INRA0056207 SNP位点的基因型为CC；(141)ASGA0080435 SNP位点的基因型为CC；(142)MARC0068495 SNP位点的基因型为GG；(143)ASGA0080436 SNP位点的基因型为CC；(144)MARC0003370 SNP位点的基因型为CC；(145)ASGA0085659 SNP位点的基因型为CC；如果不满足上述(1)至(145)的所有标准，待测猪为候选的非五指山小型猪近交系。