一种开发小麦亲缘物种特异分子标记的方法及应用

摘要

本发明属于作物遗传育种与农业生物技术领域，提供一种用于开发小麦亲缘物种百萨偃麦草特异分子标记的标记引物和方法，及该标记引物和方法的应用。本发明共提供了157对引物对，经过引物对扩增后的百萨偃麦草特异片段，全部定位于百萨偃麦草染色体上，说明该引物对的特异性；同时，通过本发明提供的百萨偃麦草特异分子标记的开发方法获得的特异扩增片段在百萨偃麦草中的多态率高达40.2％，说明本方法的可行性。本发明通过157对引物获得182个定位于百萨偃麦草染色体的分子标记，数量大，为从中发掘百萨偃麦草有益性状基因进而将有利基因通过分子标记辅助选择转移到栽培小麦中提供了便利。

主权项

一种用于开发小麦亲缘物种百萨偃麦草特异分子标记的标记引物，其特征在于：序列如下所示：1)lfz1725：上游引物TGGCTTTGTCATTGCCAGT；下游引物GCCATAACGGAGATCTGGAG；2)lfz1728：上游引物CGCAGTCAAATCAAATGGAA；下游引物CTCCAGCTCGACGGAAGC；3)lfz1730：上游引物TTGAACCCCGACTTTTTCAG；下游引物ATGTACCTCACCTCCCATGC；4)lfz1731：上游引物CGCGATGAATAGTTTGAGCA；下游引物GACAGCGAATTTGGAGAAGC；5)lfz1743：上游引物GATGTGTTTGTGCAGGTTGG；下游引物TGGGTTCAGGGAAGGATATG；6)lfz1745：上游引物GTCAGCACGACCACCTGTT；下游引物CCGGCGTCAGATGATAGAG；7)lfz1747：上游引物GAGAGGCTTGAGCCAATCAG；下游引物AATTCTGTCCTGGGCAACAC；8)lfz1751：上游引物ATGCATATGCGTCCAACTGA；下游引物ACAAGACCGAGGCTGAGATG；9)lfz1754：上游引物GAGAAGGGGCAAAATGGAAT；下游引物CTAATGGCATGGTGGTGTTG；10)lfz1755：上游引物ACACCCCAGCTGCAACTAAC；下游引物GTGAGGAGAAGGAGCAAGCA；11)lfz1756：上游引物ATGAGCACGTGAGACTGTGG；下游引物CAGGCCTCTTTGCCTCATAG；12)lfz1757：上游引物TCACAGGAAACACCATCAGG；下游引物TTGAGTGGGTACACGATTGC；13)lfz1758：上游引物GATTGAGGGAACGAGCAAGA；下游引物TGATCGATCTGACCACCAAA；14)lfz1759：上游引物AGTTGGCTTGGGTCAGATTG；下游引物TGTAGGAGGCTCGCTCAAAT；15)lfz1762：上游引物GGCCTTGTGGTAACTCCAAA；下游引物AAGCTGCCTGACGACATTCT；16)lfz1763：上游引物TTTCACCGTTTGCATTAGCA；下游引物GAAGTGGCTTTTCCATCCAA；17)lfz1767：上游引物ACTGGCTAGCACACCGACTT；下游引物CTGTGTGCTGGTTGCCTCTA；18)lfz1781：上游引物CACGTTCCATGATGTTGGTC；下游引物CCACGATCATATGCCTCCTT；19)lfz1783：上游引物CATGGAAGGCTTGAAATGGT；下游引物CCGGGTGAGTTGAGTTTGAT；20)lfz1784：上游引物GATGCCCCTAACAAGACGAA；下游引物ATGTCGGAGATCAGGTGGAC；21)lfz1790：上游引物GGATCAAGGAAGAAAGGTTGC；下游引物CTCCAACACGATGGAGGTCT；22)lfz1793：上游引物GCCACCAGAAGGATCTTGAC；下游引物CATAGCCCCTTAGCTCGTTG；23)lfz1797：上游引物TACGACTGAAGCAAGCATCG；下游引物AGGGAAACCTCCACACTTCC；24)lfz1799：上游引物CCCAAATTCCCCATTTCTCT；下游引物GGAGATGGGAGTGACCTCAA；25)lfz1804：上游引物CACGCAATTCATCGAACACT；下游引物GTATCCATAGCTGCGCCAAT；26)lfz1806：上游引物TCATCCACAAAATGGCAAAA；下游引物TTCCTCAAGTCCCACCAAAG；27)lfz1808：上游引物ATTGAACCGGTGAGAGATCG；下游引物CGATCTGCGTCTTCCCTCTA；28)lfz1809：上游引物CCACGATGGGATCAGTTACC；下游引物GCTACTTGCGTGCAACACAT；29)lfz1810：上游引物ATCGCCAGCCTCTTGAGTT；下游引物CGACACAGCAGACCATCAGT；30)lfz1816：上游引物CGGAAGGTTGCTGATGAGAT；下游引物GGCACCCACAGTCAAAAAGA；31)lfz1817：上游引物ATGACACTCACCTGCCTTCC；下游引物TTCTGGCAAACCACGTCATA；32)lfz1820：上游引物CTTCATGGCACGTACGGTTA；下游引物ATTCCACGCATCTTGAACCT；330)lfz1821：上游引物ATGAACGGGAAGTGTCGAAG；下游引物GAGGACGGTTGTAGCAAGGA；34)lfz1822：上游引物GCATCTCTGGCCTTGTCTTC；下游引物GACGGCACACTCCTCCTAGA；35)lfz1826：上游引物AGAGTGACACCGTCCGTGA；下游引物CTCCAGTCTCCCGACCTTAG；36)lfz1829：上游引物GGTGGGTATACAGCGGAGAA；下游引物GTGCTACACCGAGCCATTTT；37)lfz1836：上游引物GATATCTGCCGGTGACGAAC；下游引物CAGAGAAACACAGCAAAGCTGA；38)lfz1838：上游引物CCTGAACAAGAACCCTCCAA；下游引物AATAATACCCCCGGCTTCAG；39)lfz1841：上游引物TCCTTTCTCACTGCCCATTC；下游引物TCATGAGTGCGGTTCATCTC；40)lfz1850：上游引物TTTTTCCCTTGTGGCTTTTG；下游引物GATGCCTACCTCCCAGACAA；41)lfz1852：上游引物CAAATCCCAAGGCAGTCCTA；下游引物CTTGCCACCAATCACCTCTT；42)lfz1853：上游引物CTCGCAGAGAAGGTGGAGAC；下游引物CACCTTCGAATCCCTTGAAA；43)lfz1857：上游引物AGTCGCCGGTACGATGTAGT；下游引物ACGCTTCCTCCAGAGAGAGA；44)lfz1859：上游引物TGCCGAAGACTGAGCACTAA；下游引物TCGCCTTCTACAGTCCAGGT；45)lfz1866：上游引物TTGAGGCTCTCCCGTAAGAA；下游引物GCCCCCAGAAAGAAAGAAAA；46)lfz1876：上游引物CTGCGGTATAGGGTGACACA；下游引物GCTACTTGTTGGGCCTGAAG；47)lfz1877：上游引物TGGACAGCCTGAACATGAAG；下游引物CGCAGATGAAGATGCCCTAC；48)lfz1879：上游引物AAGAGGAGGAGCCCAGGTAG；下游引物CACGGATTCGAACTCCACTT；49)lfz1880：上游引物GCCTGGATGAAATGGAGAAA；下游引物TAGCACTGTCCAGCGATTTG；50)lfz1882：上游引物CAGGGACTTTCCTTCGATCA；下游引物GCACTGCCTTTCTCAAGGTC；51)lfz1883：上游引物GGTTGATGGGAGATGCAGAA；下游引物GGCCGACAGTATAGCTCCTG；52)lfz1884：上游引物GACAGTGACCTCGATGAGCA；下游引物AAACCATGTTTGTCGGCATT；53)lfz1886：上游引物TGAAAGTTGTAGCGCCAGTG；下游引物ACCAGAGTCGTCATCCATCC；54)lfz1899：上游引物GCTAGGTTATGCCGAAGACG；下游引物CCTCCATCTCCCATGGAGTC；55)lfz1900：上游引物GCCAAGCACATCACTCTGAA；下游引物GCGACTACATGTACCGCAAA；56)lfz1901：上游引物CATTGTCCATCCAATGAGGA；下游引物GCGACTACATGTACCGCAAA；57)lfz1906：上游引物CCACTGCATCCATCTTCCTT；下游引物GCCTTCTCTTCCATGCTTCTT；58)lfz1907：上游引物GTCCTCGATGCAGAGGAATC；下游引物TTTGCTTCACCTCCTCGTCT；59)lfz1908：上游引物GCTGGCTTGGAGCTATGTTC；下游引物TACCATCAGCCTTGGTCCTC；60)lfz1913：上游引物TCAAGTGCAGACTTGCGAAC；下游引物AAAATGGAACTGGGGGAAAC；61)lfz1914：上游引物AAGCGTACCTTCTGCAAGGA；下游引物TTTTTCGTGGCAAAGATGATT；62)lfz1917：上游引物CTCCAGCAGGTTCTCGATGT；下游引物TGTTTATCCCCTGGTTCTGG；63)lfz1920：上游引物CGACAAATGCCAGAGAGTGA；下游引物ACTGCTACGTCGCTGACCTC；64)lfz1922：上游引物TCCTTGCAGACAAGCTGGAT；下游引物CTTTGGTGTCCCCGAAATC；65)lfz1923：上游引物ATGGAAGACCGTTGAGGTTG；下游引物CTCCAACCACCTTCTTGCAC；66)lfz1924：上游引物CACCGTTCTTTGGCTATGGT；下游引物CTGATTTCTGGGTTGCTGCT；67)lfz1934：上游引物TTGCAGTACCATCGCAAAAG；下游引物GCAGCCAGATGTCTGTCCAT；68)lfz1936：上游引物ACCGCAGAATCAACAGGAGT；下游引物GCCCTCCCTTGCTTTACTTT；69)lfz2213：上游引物AATAACAAACGGCAGGAACG；下游引物AGCCACGATCAACGATAAGG；70)lfz2214：上游引物CTCGCTAGTCGGGAAGGAG；下游引物CGGACATGGACAGAGATGGT；71)lfz2215：上游引物CTCAGACGGGAGGAAGACAG；下游引物ATCGAGTACTTCCCGCTCCT；72)lfz2220：上游引物GCAGCATTCAGCAAAAATCA；下游引物ATTGGGGAGGTAGGATGAGG；73)lfz2221：上游引物GGGATGGTTGCTTGTGAAAC；下游引物TCAATTTCATTGCCCAGACA；74)lfz2222：上游引物GGCCACGCCTCTGAGTTAC；下游引物AGAGGCCTAGGTGGCTCATT；75)lfz2225：上游引物TTGAGTGAGCATCGATGGAG；下游引物CCTGAAATCGCAGCACTGTA；76)lfz2226：上游引物ACTGGAACGATGAGGACTGC；下游引物TGTCACAACCATCATGAGCA；77)lfz2228：上游引物CGTCATCACTGCGAGAAGAA；下游引物GCACGTCCACATACATTTGC；78)lfz2229：上游引物CTCCGACCTTGACTCCTCTG；下游引物TGTCTACCGAGTTGCTCACG；79)lfz2232：上游引物ACTTACACATGGGGCACACA；下游引物AATGAGGAAGGCATCCATTG；80)lfz2233：上游引物TCCCAAGGTGACCATTTTGT；下游引物GAAACGGTTGCTGTGAAGGT；81)lfz2235：上游引物GAGCTCACCGAGTGGTTCTG；下游引物TTGTGGTGGAGGTACACGAA；82)lfz2237：上游引GACCGAACGATTTGATCCAC；下游引物CGAAAATAAAACCGCAGGAG；83)lfz2240：上游引物CACGCCCAGACTCAGATACA；下游引物AAGGAATGATCCTCGACCAA；84)lfz2241：上游引物GGATTGACAAGAGGCAGGAA；下游引物GAAACAGGGGAAGGAAGGAG；85)lfz2244：上游引物CAAAATCCTGCAACCCTGAT；下游引物CTCTTCATAGGCCGCTTCAG；86)lfz2247：上游引物GGGATCTGATTTTCGAGTGC；下游引物GACGAAAGGAAAACGGAACA；87)lfz2249：上游引物ACATTGGAGGAACCCATCCT；下游引物GCAGCCGCCAAATTAGAT；88)lfz2254：上游引物GGCCGTGAAGTAATGATGGT；下游引物TTAGCAGATTTGCCCACCTC；89)lfz2256：上游引物GGCTTTGTGAACCGATTGAG；下游引物GAGGGCTTTATGCTCGTCTG；90)lfz2257：上游引物GGCTTTGTGAACCGATTGAG；下游引物GAGGGCTTTATGCTCGTCTG；91)lfz2258：上游引物TCCCAACAGCTGCCTTAGTC；下游引物CTTTCTCTCCCCGTCTCCTT；92)lfz2263：上游引物GCAAGATCCCCCATCAGTTA；下游引物CAGCCACTCCATTACCCAGT；93)lfz2264：上游引物ACCCGAAAATAGGGGAGAAA；下游引物CCCTGAATTCACTCCTCTGC；94)lfz2267：上游引物CATCCAGATCTCCGGCTAGA；下游引物ATTTTCGCACACACTCCACA；95)lfz2268：上游引物ACGTCTGGCGAACAATTACC；下游引物AGGGCACTGCGTAGATGAAG；96)lfz2274：上游引物TGGAGGAGGTAGTGGATTCG；下游引物ATGGAGGAAGGACGTGTGAG；97)lfz2281：上游引物GCAGTGGAAGATGAGGTGGT；下游引物GCGTGTGTGCTTCTTCATGT；98)lfz2282：上游引物TTTGGGGGATTCGTCCTAGT；下游引物CGTAGCCGGAAGACAGACTC；99)lfz2283：上游引物GGGGATAAGCAGCAGAGACA；下游引物TACGAGGCTGGGTCCTCTAA；100)lfz2287：上游引物CTTCTCCCCCTTGAGAGTCC；下游引物ACGACAGGGAGGAATGAATG；101)lfz2296：上游引物GAAGCTGCGGCTACTCAATC；下游引物GGTATCAACTGTAACTCTT；102)lfz2304：上游引物AAGCCTTATGGGAGGCAGTT；下游引物GAACCCCAAGGATCCTGAAT；103)lfz2306：上游引物CCTTATCCAATCCCGTCTCA；下游引物CCGCACTTGACTGCTACAGA；104)lfz2308：上游引物TCACACGAACCAACGAGAAC；下游引物TACTGGAACATGGGCCTAGC；105)lfz2310：上游引物CTTGCTTCTCCCACTTGCTC；下游引物TTTGATGGGCTTTGGTTAGG；106)lfz2314：上游引物GGCTGTCGTACTGGACGAAT；下游引物CCAGTGGCATCAGTCCATC；107)lfz2318：上游引物GGGTTGCTGAGTCCACTGAT；下游引物CTCGGGGATCATTCAAGAAA；108)lfz2322：上游引物TCATGGCTCACATGGCTATC；下游引物ACAATTGGGACCATCCAAAA；109)lfz2325：上游引物TCGATCACCCACAAGAACAA；下游引物AGAGAGCGGACGTGTTCAGT；110)lfz2326：上游引物CTGCTGAAACTCCCCAAGAC；下游引物CGGCGTGTACATAGCATAGG；111)lfz2327：上游引物GTGGCTCGATGACGAATACC；下游引物TGCTGTGTTCTCCTCCCTTT；112)lfz2330：上游引物ATCGGAGAGCTTCTGTTCCA；下游引物ATTTGGTGGCCTTCACTGTC；113)lfz2335：上游引物CTAGTCCCAGCGCCTAACAA；下游引物TAAAATCGGCCTCATCCTTG；114)lfz2336：上游引物ACACAGTGGGAAGTGGGAAG；下游引物CTCTAGTCGCACGGTCTGGT；115)lfz2337：上游引物GACGGAAGGTTGGACAAAAA；下游引物TTCCTCCTCCCTTCCACTCT；116)lfz2339：上游引物GCCTTTGCCTAGCCTAGCTT；下游引物CAGCCACCCTCAGGTGTTAT；117)lfz2340：上游引物TGTCTCTGGCGAGTTTCTGA；下游引物AGCAATCCAGTCCTCGTCAC；118)lfz2341：上游引物TTTCCATGTCAAGGTGGTCA；下游引物CACCAACACAACGACACCTC；119)lfz2342：上游引物GTGGCCCTTTCCTTCTCTCT；下游引物ACCAGAAGGTCCCAGAGGAT；120)lfz2343：上游引物TCTTCTTCCTCACGCCCTTA；下游引物GCTCGAGTCCGTAGAAGTGG；121)lfz2344：上游引物GCTTAACGCTTCTGGTCGTC；下游引物GCCGCTAGTGTAGCAGGTCT；122)lfz2345：上游引物GCGAATCGTTACACGGAAAT；下游引物TCGGTGAGGTGAAAGGTCTC；123)lfz2346：上游引物CAGACTCAGCAGACCAACCA；下游引物CATCTCCACCCAATGGTTTT；124)lfz2349：上游引物CCGTGGCAATAAGAGGAAAA；下游引物CTTGATTTCAGCAGGCTTCC；125)lfz2352：上游引物AGCCAGGAGTTGGTGCTCTA；下游引物ATGCGAACGAGGATCAAAAG；126)lfz2354：上游引物ACGGACTCTTCTCCCTCCAT；下游引物TAGTGCAGCATCCGTTCTTG；127)lfz2358：上游引物GCTGCAGCCACCTTATTCTC；下游引物AACCCCGGATCTATGTTTCC；128)lfz2375：上游引物CCCACACCACTCCTTCAACT；下游引物TTTGACCTCGGTTTGTCCTC；129)lfz2386：上游引物TGTAGAATCCTTGGGCCATC；下游引物TTGCACTTTCTGTGGCATGT；130)lfz2393：上游引物AGAAGATTGCTGAGGGCAAA；下游引物CCATTGAGGCGCTGAATTAT；131)lfz2394：上游引物GACGAGGATTCTGCATGGTT；下游引物CCCTCATCCTTCAAGTCCAA；132)lfz2395：上游引物AAAAGGCTCCTCACAAGCAA；下游引物CAACGAGCTTGATGCTGAAA；133)lfz2396：上游引物GACGAAGAAGAGGCAAGGTG；下游引物TCTCCCTCATCTCGGTTCTC；134)lfz2403：上游引物TGCAGCTACTGCAATCAAGG；下游引物ATTTTGCTGTGGGCTGTAGG；135)lfz2405：上游引物TGTAGAAGCAGGGGGAGTTG；下游引物CCAGCAGTTCATCACCTGAA；136)lfz2406：上游引物TGGAGACAGTGAGGCTGTTG；下游引物CCTTGCATAGCTCCCTTGAG；137)lfz2407：上游引物CAGGCTGTATGTGCTTGACC；下游引物GGCGTCGCTAGTGAGATAGG；138)lfz2408：上游引物AGTCGCCCAATGTATCCAAC；下游引物CGATATCCATTCGGTGCTCT；139)lfz2416：上游引物ACTCGGAGCAGCGAAAGTAG；下游引物AGGCCTATGCACAGCCATAC；140)lfz2420：上游引物GTGTGCACAAATGCTCTGCT；下游引物ACGATCAATCCCAGCATCTC；141)lfz2422：上游引物TTTGAAATGTCCTCGCACAG；下游引物AAGGAACGCATATGGAATCG；142)lfz2453：上游引物AAAACGAGGCATCACAATCC；下游引物GCTTAGCGAAGAGCTTGCAT；143)lfz2457：上游引物AGAAGAGTGCGGATGCTGAT；下游引物AATCTGCTCAAGCCCTGAAA；144)lfz2459：上游引物GGGGCTACAATCACCCAGTA；下游引物GCAGCAAGCAAAAACTTTCC；145)lfz2463：上游引物ACTTGGATGGCAAATTGGAG；下游引物TTCTCCAGGCGAAGTTGTCT；146)lfz2466：上游引物GCAGCAAACTGGGTCAAAAT；下游引物TGAGGAAAAACTGGGTCAGG；147)lfz2467：上游引物CTACATGCTGGTTGGCTGAA；下游引物CACCCTACCTTGCTCGTCTC；148)lfz2472：上游引物CCCTGTTGCTCAAGATGGAT；下游引物TGGACGAGCAAGACTGACAC；149)lfz2473：上游引物TGTCGCGTGATGTGGTATTT；下游引物TCATCGCAATTTGACTGAGC；150)lfz2475：上游引物TGAGGTGGTTGTCGGAGAG；下游引物GTACTTGCTTTCGCCTGGAA；151)lfz2481：上游引物AACCAGCTTCGCAGGAGAG；下游引物AGTGGTGTCGTGATCGAGGT；152)lfz2484：上游引物TCAACCTCCTCAGCTTGCTT；下游引物GCGTCCAATCGTGATTTTCT；153)lfz2486：上游引物GCCCAACATCAATCAGACCT；下游引物TACACTGCCCGTTCGTGATA；154)lfz2493：上游引物CGAGGAGGAGAGGTTGAGTG；下游引物TCCTCATGGAAGAAGGCAAC；155)lfz2495：上游引物TCGAACAGGACGAGGAAGTC；下游引物GGACCAGCCACAAGTTCATC；156)lfz2499：上游引物GGCTTCACGCATGAAATTCT；下游引物AGCTCGGCAGTGTCAACTTT；157)lfz2501：上游引物ATAAAAAGGCAAGCCCACCT；下游引物CAAGTGGAACAGAGCAAGCA。