一种中华绒螫蟹多元高通量遗传标记系统及遗传分析方法

摘要

本发明涉及水产遗传育种领域，具体说是一种中华绒螯蟹多元高通量遗传标记系统及遗传分析方法。多元高通量遗传标记系统为线粒体序列信息系统和微卫星分子标记系统，其中微卫星分子标记系统为由7个EST-SSR标记的系统1和6个EST-SSR标记的系统2组成；方法：运用线粒体的三对引物扩增COI，Cytb和CR的序列的信息作为分子标记，将混养家系中同一母本和不同母本所产的后代根据遗传结构和遗传多样性分开，再运用EST-SSR微卫星分子标记，将已区分母本的后代根据遗传距离和遗传多样性进行父本的区分，从而完成中华绒螯蟹遗传育种过程中的系谱认证并确认近交系数。本发明在有效利用物种遗传信息的基础上，使用多元高通量遗传标记系统区分子代之间的亲缘关系，同时有效避免近交衰退。

主权项

一种中华绒螯蟹多元高通量遗传标记系统，其特征在于：所述多元高通量遗传标记系统为线粒体序列信息系统和微卫星分子标记系统，其中微卫星分子标记系统为由7个EST‑SSR标记的系统1和6个EST‑SSR标记的系统2组成；系统1由7个EST‑SSR标记组成，扩增7个EST‑SSR标记的7对引物分别是NE5：F 5′‑CGTGAATGCTGTAGTGTAAT‑3′；      R 5′‑CACCAGAAATAATGAGGTTT‑3′；NE12：F 5′‑ATGACATTGATGCCTGACG‑3′；      R 5′‑TGCCTTTATTGACCGAGAC‑3′；NE16：F 5′‑TTTCACATCCTCCACAGACA‑3′；      R 5′‑GCCACAAGTACACCCAATCA‑3′；NE27：F 5′‑ACGGGAAATGGAACAGAT‑3′；      R 5′‑TCCTTCCATCCTGAGTCC‑3′；NE46：F 5′‑ACTGCTGTTGTTGGTGGTC‑3′；      R 5′‑CCTTAATCCGTTGCGTCA‑3′；NE48：F 5′‑AAAGGTCAGTTAATTTCTTGAT‑3′；      R 5′‑TCTAGTGAAATGACATATTGGT‑3′；NE49：F 5′‑AGACCGCTGTTATGCTCCT‑3′；      R 5′‑ATGGGAATGAAGGTTATGTATG‑3′；系统2由6个EST‑SSR标记组成，扩增6个EST‑SSR标记的6对引物分别是NE1：F 5′‑CATTCCAAGTCTTGACCCC‑3′；      R：5′‑CAGAGCCACAACACTAACG‑3′；NE18：F 5′‑TATTCAACATTTCAACAACGAT‑3′；      R：5′‑GACGAGCGAAGAACTGGA‑3′；NE23：F 5′‑AGAGGCAAATGCGATAAAGA‑3′；      R：5′‑CACGACAGACTTACCAGCAC‑3′；NE25：F 5′‑AGGAGGTGCGTAAGAGTGA‑3′；      R：5′‑TTTCCTTCCATCCTGAGTC‑3′；NE26：F 5′‑ACGGGAAATGGAACAGAT‑3′；      R：5′‑TCCTTCCATCCTGAGTCC‑3′；NE36：F 5′‑ATGTGGACTGCGGGAGA‑3′；      R：5′‑GTGGTGGTAGGTTCGTCTGT‑3′；线粒体序列信息系统由扩增COI，Cytb和CR序列的三对引物组成，这三对引物分别是，LCO1490：5′‑GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG‑3′和HCO2193：5′‑TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA‑3′、F1：5′‑CATGCCTGAATAGTAGGAGT‑3′和R1：5′‑GTGCTCCAATTCAGGTCAAT‑3′、F2：5′‑GACCGTTGAGACTACTACTATAATA‑3′和R2：5′‑TCCGTTGCATGTAAGTATATAGTAG‑3′。