发明名称 金字塔型筛选方法对内源性代谢产物进行分类与鉴定的方法
摘要 本发明公开了一种采用金字塔型筛选方法对内源性代谢产物进行分类与鉴定的方法。它是将由Masslynx软件提取的色谱峰数据导入Excel表格中;根据不同能量碰撞裂解的过程,在正离子模式下,查找母离子要符合[M+H]+、[M+Na]+、[M+K]+或[M+H+Na]+的条件;在负离子模式下,查找母离子要符合[M-H]-或[M-HAC]-的条件,对碎片离子进行合并;利用金字塔型筛选方法,对大量的生物样本数据进行不同类别的目标化合物的分类与筛选:经HMDB与KEGG等数据库查询验证,进一步确认目标化合物结构等信息。本发明对脂质组学、石油化工、中药分析等领域中化合物的分类、鉴定、发现、分离都有着重要的指导意义。
申请公布号 CN104237493A 申请公布日期 2014.12.24
申请号 CN201410329539.1 申请日期 2014.07.11
申请人 天津中医药大学 发明人 张艳军;李遇伯;张振珠;侯治国;王磊;武欣;张秀秀
分类号 G01N33/48(2006.01)I 主分类号 G01N33/48(2006.01)I
代理机构 天津市杰盈专利代理有限公司 12207 代理人 朱红星
主权项 一种采用金字塔型筛选方法对内源性代谢产物进行分类与鉴定的方法,其特征在于按如下的步骤进行:(1)  将由Masslynx软件提取的色谱峰数据导入Excel表格中;(2)根据不同能量碰撞裂解的过程,在正离子模式下,查找母离子要符合[M+H]<sup>+</sup>、[M+Na]<sup>+</sup>、[M+K]<sup>+</sup>或[M+H+Na]<sup>+</sup>的条件;在负离子模式下,查找母离子要符合[M‑H]<sup>‑</sup>或[M‑HAC]<sup>‑</sup>的条件,对碎片离子进行合并;(3)利用金字塔型筛选方法,对大量的生物样本数据进行不同类别的目标化合物的分类与筛选:(4)经HMDB与KEGG等数据库查询验证,进一步确认目标化合物结构等信息;其中所述的金字塔型筛选方法指的是:1)当化合物分子质量与质量亏损值分别在60.0‑204.1和‑0.0046‑0.1150范围内时,则此类物质属于第I类物质,随后对不同能量碰撞诱导下的离子碎片进行进一步筛选,正离子模式下,若丢失NH<sub>3</sub>和HCOOH的中性丢失碎片,则为氨基酸;若丢失NH<sub>3</sub>的中性丢失碎片,则为碱基或单胺类神经递质;负离子模式下,若丢失CO<sub>2</sub>的中性丢失碎片,则为有机酸;2)当化合物分子质量与质量亏损值分别在227.0‑364.3和0.0695‑0.240范围内时,则此类物质属于第II类物质,即核苷和类固醇激素;在正离子模式下,若含有m/z 97.06[C<sub>6</sub>H<sub>9</sub>O]<sup>+</sup>和m/z 109.06[C<sub>7</sub>H<sub>9</sub>O]<sup>+</sup>的诊断碎片和对应0.0643‑0.0662和0.0642‑0.0663  Da的诊断碎片质量亏损范围时,则为类固醇激素;在负离子模式下,若含有m/z 145.06[C<sub>10</sub>H<sub>9</sub>O]<sup>‑</sup>的诊断碎片和0.0638‑0.0667  Da的诊断碎片质量亏损范围,则为雌激素;正离子模式下,若丢失C5H8O3和C5H8O4中性丢失碎片,则为核苷;3)当化合物分子质量与质量亏损值分别在412.2‑607.5和0.2385‑0.4576范围内时,则此类物质属于第III类物质,即LPEs和LPCs;正离子模式下,若含有m/z 184.07[C<sub>5</sub>H<sub>15</sub>NO<sub>4</sub>P]<sup>+</sup>的诊断碎片和0.0720‑0.0757  Da的诊断碎片质量亏损范围,则为LPCs;若丢失(C<sub>2</sub>H<sub>8</sub>NO<sub>4</sub>P)的中性丢失碎片,则为LPEs;当化合物分子质量与质量亏损值分别在635.4‑915.8和0.4369‑0.8125范围内时,则此类物质属于第IV类物质,即PCs/PEs/PSs/PIs/PAs/PGs物质;正离子模式下,若含有m/z 184.07[C<sub>5</sub>H<sub>15</sub>NO<sub>4</sub>P]<sup>+</sup>的诊断碎片和0.0720‑0.0757  Da的诊断碎片质量亏损范围,则为PCs;若丢失(C<sub>2</sub>H<sub>8</sub>NO<sub>4</sub>P)的中性丢失碎片,则为PEs;负离子模式下,若含有m/z 241.01[C<sub>6</sub>H<sub>10</sub>PO<sub>8</sub>]<sup>‑</sup>的诊断碎片和0.0088‑0.0137  Da的诊断碎片质量亏损值范围,则为PIs;若含有m/z 152.99[C<sub>3</sub>H<sub>6</sub>PO<sub>5</sub>]<sup>‑</sup>的诊断碎片和0.9937‑0.9968Da的诊断碎片质量亏损范围,则为PAs/PGs;若丢失(C<sub>3</sub>H<sub>5</sub>NO<sub>2</sub>)的中性丢失碎片,则为PSs,最终对已筛选出的不同类别的化合物,进行HMDB数据库的查询,以期快速准确的筛选出目标化合物。
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