发明名称 一种金针菇三明BX3菌种的SSR标记指纹图谱与应用
摘要 本发明涉及一种金针菇三明BX3菌种的SSR标记指纹图谱与应用,该指纹图谱由6对基于金针菇基因组序列开发的SSR标记的特异等位片段组合而成。应用包括:对金针菇菌种进行SSR标记扩增,将得到的带型与指纹图谱对照,与该指纹图谱一致即为三明BX3菌种。本发明与常规形态学检测、拮抗试验、出菇试验相比,具有检测时间短、准确性高、可重复性好的优点,在收集的我国24个主栽金针菇菌种中具有三明BX3菌种的专一性。
申请公布号 CN104131085A 申请公布日期 2014.11.05
申请号 CN201410317258.4 申请日期 2014.07.04
申请人 上海市农业科学院 发明人 王瑞娟;徐珍;尚晓冬;陆欢;章炉军;张丹;谭琦
分类号 C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 上海泰能知识产权代理事务所 31233 代理人 黄志达
主权项 一种金针菇三明BX3菌种的SSR标记指纹图谱,其特征在于:该指纹图谱由6对基于金针菇基因组序列开发的SSR标记的特异等位片段组合而成,6对SSR标记在金针菇三明BX3菌种上扩增的等位片段信息具体为:Fv_fp0001的等位片段的数量为1,等位片段1相对于50bp DNA ladder的分子量为700bp;Fv_fp0002的等位片段的数量为2,等位片段1相对于50bp DNA ladder的分子量为1300bp,等位片段3相对于50bp DNA ladder的分子量为780bp;Fv_fp0003的等位片段的数量为4,等位片段1相对于50bp DNA ladder的分子量为1000bp;等位片段2相对于50bp DNA ladder的分子量为680bp;等位片段3相对于50bp DNA ladder的分子量为600bp;等位片段4相对于50bp DNA ladder的分子量为500bp;Fv_fp0004的等位片段的数量为2,等位片段2相对于50bp DNA ladder的分子量为1200bp;等位片段3相对于50bp DNA ladder的分子量为1100bp;Fv_fp0005的等位片段的数量为2,等位片段1相对于50bp DNA ladder的分子量为1100bp,等位片段2相对于50bp DNA ladder的分子量为800bp;Fv_fp0006的等位片段的数量为2,等位片段2相对于50bp DNA ladder的分子量为370bp;等位片段3相对于50bp DNA ladder的分子量为360bp。
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