基于并行计算的代谢组学数据处理方法

摘要

本发明公开了一种基于并行计算的代谢组学数据处理方法，包括如下步骤：步骤(1)：将样本送入色谱-质谱检测仪，得到以谱图的形式显示的原始数据和样品组分的保留时间；步骤(2)：将并行计算与MZmine软件结合实现数据处理的并行化：将步骤(1)得到的原始数据根据谱峰和样品组分的保留时间来进行任务分解，将分解后得到的子任务交由若干个均配置有MZmine软件的服务器进行并行计算；得到样品组分的数据表格；步骤(3)：将计算结果合并汇总，基于并行计算的数据处理方法能提高数据处理速度，节约计算成本。

主权项

一种基于并行计算的代谢组学数据处理方法，其特征是，包括如下步骤：步骤(1)：将动物血清样品送入色谱‑质谱检测仪，经过色谱‑质谱检测仪的处理后，色谱‑质谱检测仪输出原始数据，所述原始数据为以样品组分的保留时间为横坐标，以样品组分的峰值浓度为纵坐标的原始谱图；步骤(2)：将并行计算与MZmine软件结合实现数据处理的并行化：将步骤(1)得到的原始谱图，根据原始数据的样品中组成成分的谱峰的数量和样品组分的保留时间来进行任务分解，分解成若干个子任务，为提高并行计算的数据处理速度，任务分解的要求是分解后的每个子任务内谱峰高度满足设定阈值的谱峰数量是大致相等的；将分解后得到的子任务交由若干个均配置有MZmine软件的服务器进行并行计算；计算得到样品包含的物质的成分，进而得到样品组分的数据表格；步骤(3)：数据输出。