发明名称 |
一种基于决策树判别环境中化合物对非洲爪蟾是否具有雌激素效应的方法 |
摘要 |
一种基于决策树判别环境中化合物对非洲爪蟾是否具有雌激素效应的方法,包括步骤:对非洲爪蟾雌激素受体蛋白ERβ进行同源建模及评价;运用分子模拟软件DS获取化合物的物理参数,以及化合物对小鼠、非洲爪蟾的结合能,分析小鼠-化合物的结合能与非洲爪蟾-化合物的结合能的线性关系;通过化合物对小鼠的物理参数和结合能建立化合物对小鼠有无雌激素效应的决策树;利用小鼠和非洲爪蟾结合能之间的线性关系,构建化合物对非洲爪蟾有无雌激素效应的决策树。本发明适用范围广,无需复杂的检测设备,不造成试验和环境污染,建立简便、快捷的化合物对非洲爪蟾雌激素效应的判断方法,为实施具有雌激素效应污染物的排放、生态风险评价提供科学依据。 |
申请公布号 |
CN104102828A |
申请公布日期 |
2014.10.15 |
申请号 |
CN201410321359.9 |
申请日期 |
2014.07.07 |
申请人 |
同济大学 |
发明人 |
林志芬;丛永平;郑晓峰;尹大强;陈瑞 |
分类号 |
G06F19/00(2011.01)I |
主分类号 |
G06F19/00(2011.01)I |
代理机构 |
上海智信专利代理有限公司 31002 |
代理人 |
吴林松 |
主权项 |
一种基于决策树判别环境中化合物对非洲爪蟾是否具有雌激素效应的方法,其特征在于:包括以下步骤:(1)对非洲爪蟾雌激素受体蛋白ERβ进行同源建模及评价;(2)运用分子模拟软件DS获取化合物的物理参数,以及化合物对小鼠、非洲爪蟾的结合能,分析小鼠‑化合物的结合能与非洲爪蟾‑化合物的结合能的线性关系;(3)通过化合物对小鼠的物理参数和结合能建立化合物对小鼠有无雌激素效应的决策树;(4)利用小鼠和非洲爪蟾结合能之间的线性关系,构建化合物对非洲爪蟾有无雌激素效应的决策树。 |
地址 |
200092 上海市杨浦区四平路1239号 |