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Verfahren zur Detektion von mindestens einem kleinen Oligonukleotid, umfassend: Bereitstellen eines biologischen Isolats umfassend mindestens ein kleines Oligonukleotid; in Kontakt bringen des biologischen Isolats mit mindestens einem Detektionsoligonukleotid und mindestens einem Brückenoligonukleotid unter solchen Bedingungen, dass das mindestens eine kleine Oligonukleotid und das mindestens eine Detektionsoligonukleotid vorzugsweise zu dem Brückenoligonukleotid hinzugefügt werden, um mindestens ein markiertes kleines Oligonukleotid hervorzubringen, wobei das mindestens eine Detektionsoligonukleotid ein 5'-Ende, ein 3'-Ende sowie einen markierenden Rest aufweist, wobei der markierende Rest mit dem 5'-Ende, dem 3'-Ende oder einem inneren Abschnitt des Detektionsoligonukleotids verbunden ist, wobei das 5'-Ende des Detektionsoligonukleotids ein Phosphat einschließt und über eine Phosphoramidbindung mit dem markierenden Rest verbunden ist; Zugabe von mindestens einem ligierenden Reagens, um das mindestens eine kleine Oligonukleotid und das mindestens eine Detektionsoligonukleotid vorzugsweise miteinander zu verbinden; und Detektion des mindestens einen markierten kleinen Oligonukleotids. |
