基于峰强度识别能力的蛋白质二级质谱鉴定方法

摘要

本发明公开了一种基于峰强度识别能力的蛋白质二级质谱鉴定方法，该方法首先虚拟酶解蛋白质数据库序列，并根据肽段的质量数对酶解后的肽段建立肽段数据库和肽段数据库索引，接着根据待分析实验图谱中母离子去电荷后的质量数在建立的肽段数据库中找出符合要求的候选肽段，再对待分析实验图谱进行去同位素峰和选取有效峰，产生符合要求的候选肽段的理论图谱，统计不同离子的峰强度信息，并计算出不同离子类型在不同区间内峰强度识别能力，对每个候选肽段基于峰强度识别能力进行打分，选择最高得分的肽段作为此实验图谱鉴定结果，最后对鉴定结果进行质量控制。该方法鉴定有效质谱的数量和蛋白质肽段数量均高于目前现有算法，且可动态选峰，运行速度快。

主权项

一种基于峰强度识别能力的蛋白质二级质谱鉴定方法，其特征在于，包括如下步骤：(1)虚拟酶解蛋白质数据库序列，并根据肽段的质量数对酶解后的肽段建立肽段数据库和肽段数据库索引；(2)根据待分析实验图谱中母离子去电荷后的质量数在步骤(1)所述的肽段数据库中找出符合要求的候选肽段；(3)对待分析实验图谱进行去同位素峰和选取有效峰；(4)产生符合要求的候选肽段的理论图谱；(5)统计不同离子的峰强度信息，并计算出不同离子类型在不同区间内峰强度识别能力；(6)对每个候选肽段基于峰强度识别能力进行打分，选择最高得分的肽段作为此实验图谱鉴定结果，并对鉴定结果进行质量控制。